Debian Med Typesetting packages

KiNG (Kinemage, Next Generation) is an interactive system for three-dimensional vector graphics. It supports a set of graphics primitives that make it suitable for many types of graphs, plots, and other illustrations; although its first use was to display macromolecular structures for biophysical research. KiNG builds on Mage, JavaMage, and the "kinemage" (kinetic image) concept to deliver a full-featured Java application with a user-friendly interface and integrated editing features. The KiNG jar file can be used within a web page as a Java applet or Java object to promote easy access to kinemages or coordinate files from a web browser.

Balík biblatex, ktorého autorom je Philipp Lehman sa stáva pre používateľov LaTeXu de facto štandardným nástrojom na správu citácií. BibLaTeX sa spoliehal na program BibTeX iba kvôli triedeniu a tvorbe veľmi všeobecného súboru .bbl bez akýchkoľvek inštrukcií ohľadne formátovania. O všetko ostatné sa stará biblatex, ktorý poskytuje autorom citačných štýlov mocné a flexibilné rozhranie makier.

Biber ponúka veľkú nadmnožinu funkcií BibTeXu pre používateľov BibLaTeXu. Okrem toho ponúka plnú podporu UTF-8 (Unicode 6.0), plne nastaviteľné zoraďovanie, výstup do GraphViz pomáhajúci pri vizualizácii komplexných krížových odkazov, podporu vzdialených zdrojov dát, overenie štruktúry dát oproti (prispôsobiteľnému) dátovému modelu a oveľa viac.

Bibus je bibliografická databáza, ktorá bola vyvinutá s ohľadom na LibreOffice/OpenOffice.org. Dokáže priamo vkladať citácie a formátovať bibliografický register v dokumente Textového procesora OpenOffice.org. Medzi hlavné vlastnosti patria:

• hierarchická organizácia referencií s používateľsky definovanými kľúčmi
• navrhnuté pre viacpoužívateľské prostredia (zdieľanie databázy medzi používateľmi)
• vyhľadávač podporujúci live požiadavky
• online prístup do PubMed
• import záznamov PubMed (Medline), EndNote/Refer, RIS a BibTeX

Bibus štandardne použije ako úložisko databázu SQLite (prostredníctvom modulu SQLite3 dostupného pre Python >2.5). Ale podporuje tiež databázy MySQL. Ak chcete použiť databázu MySQL, uistite sa, že máte nainštalovaný modul python-mysqldb.

An application to manage bibliography databases in the BibTeX format. KBibTeX can be used as a standalone program, but can also be embedded into other KDE applications (e.g. as bibliography editor into Kile).

KBibTeX can query online resources (e.g. Google scholar) via customizable search URLs. It is also able to import complete datasets from NCBI Pubmed. It also supports tagging references with keywords and manages references to local files.

BibTeX files can be exported into HTML, XML, PDF, PS and RTF format using a number of citation styles.

qqman is an add-on package for the R statistical environment. This package provides functions for visualizing Genome-Wide Association Studies (GWAS) results using Manhattan plots and Quantile-Quantile plots.