Debian Med Typesetting packages

KiNG (Kinemage, Next Generation) est un système interactif pour des graphismes vectoriels en trois dimensions. Il prend en charge un ensemble de primitives de graphisme qui le rendent adapté à beaucoup de types de graphe, de tracé et à d’autres illustrations, bien que son but premier était d’afficher des structures de macromolécules pour la recherche biophysique. KiNG est construit sur Mage, JavaMage et le concept de « kinemage » (image cinétique) pour fournir une application Java pleine de possibilités avec une interface conviviale et des fonctionnalités d’édition intégrées. Le fichier jar de KiNG peut être utilisé dans une page web sous forme d’appliquette Java, ou d’un objet Java pour fournir un accès aisé aux kinemages ou aux fichiers de coordonnées à partir d’un navigateur web.

Le paquet biblatex de Philipp Lehman est en train de devenir l'outil ultime de gestion de citations pour les utilisateurs de LaTeX. Biblatex s'est reposé sur le vénérable programme BibTex uniquement pour trier et créer un fichier .bbl très générique sans aucune instruction de mise en forme. Tout le reste est pris en charge par biblatex, qui fournit une interface de macros puissante et flexible pour les auteurs de styles de citation.

Biber propose un important surensemble des fonctionnalités de BibTex pour les utilisateurs de BibLaTeX. De plus, il propose une prise en charge complète d'UTF-8 (Unicode 6.0), un tri entièrement personnalisable, une sortie en GraphViz pour aider à visualiser les références croisées complexes, la prise en charge de sources de données distantes, la validation structurelle des données par un modèle de données (personnalisable) et bien plus.

Bibus est une base de données bibliographiques développée pour fonctionner avec LibreOffice et OpenOffice.org. Elle permet d'insérer directement des citations et de mettre en forme un index bibliographique dans un document du traitement de texte OpenOffice.org. Ses principales fonctionnalités sont :

 − organisation hiérarchique des références avec tris personnalisés ;
 − adaptation au travail collaboratif (base de données partagée entre
   utilisateurs) ;
 − moteur de recherche gérant les requêtes en direct ;
 − accès à la base de données en ligne PubMed ;
 − importation des enregistrements PubMed (Medline), EndNote/Refer, RIS et
   BibTeX.

Bibus utilisera par défaut le système de gestion de bases de données SQLite (via le module SQLite3 de Python >2.5). MySQL est également pris en charge. Pour l'utiliser, le paquet python-mysqldb doit être installé.

Il s’agit d’une application pour gérer des bases de données bibliographiques au format BibTeX. KBibTeX peut être utilisé comme programme autonome mais peut aussi être incorporé dans d’autres applications de KDE (par exemple, comme éditeur bibliographique dans Kile).

KBibTeX peut rechercher des ressources en ligne (par exemple, Google scholar) à l’aide d’URL de recherche personnalisés. Il est aussi capable d’importer des ensembles de données complets de NCBI Pubmed. Il prend en charge l’étiquetage de références avec des mots-clefs et gère les références vers des fichiers locaux.

Les fichiers BibTeX peuvent être exportés dans le format HTML, XML, PDF, PS ou RTF en utilisant un certain nombre de styles de citation.

qqman is an add-on package for the R statistical environment. This package provides functions for visualizing Genome-Wide Association Studies (GWAS) results using Manhattan plots and Quantile-Quantile plots.