Debian Science typesetting packages

AUCTeX é um ambiente integrado, personalizável e abrangente para escrever arquivos de entrada para TeX/LaTeX/ConTeXt/Texinfo usando GNU Emacs.

Oferece suporte ao processamento de arquivos-fonte através da execução do TeX e ferramentas relacionadas (como filtros de saída, pós-processadores para geração de índices e bibliografias, e visualizadores) de dentro do Emacs. AUCTeX permite a navegação através de erros reportados pelo TeX, ao mesmo tempo em que move o cursor diretamente para o erro reportado e exibe alguma documentação sobre aquele erro em particular. Isso funcionará mesmo que o documento esteja dividido em vários arquivos.

AUCTeX pode automaticamente indentar código-fonte LaTeX, tanto linha por linha quanto para o documento todo, além de possuir um recurso de destaque especial que pode ajudar muito a ter uma visão geral de um documento.

AUCTeX é escrito inteiramente em Emacs Lisp e portanto pode ser melhorado com novos recursos para necessidades específicas. Vem com uma grande variedade de macros Emacs úteis. É um projeto GNU e a documentação para todos os seus recursos está acessível através no navegador info do Emacs.

O pacote biblatex de Philipp Lehman está se tornando a ferramenta de gerenciamento de citações definitiva para usuários(as) LaTeX. Biblatex tem se baseado no venerável programa BibTeX apenas para classificar e gerar um arquivo muito .bbl genérico sem qualquer instrução de formatação. Tudo o resto é cuidado pelo biblatex, que fornece uma poderosa e flexível interface de macro para autores(as) de estilos de citação.

Biber oferece um grande superconjunto da funcionalidades BibTeX para usuários(as) BibLaTeX. Além disso, oferece recursos completos UTF-8 (Unicode 6.0), classificação totalmente personalizável, saída para GraphViz para ajudar a visualizar referências cruzadas complexas, suporte para fontes de dados remotas, validação estrutural dos dados contra o modelo de dados (personalizável) e um muito mais.

Bibus é um banco de dados bibliográfico que foi desenvolvido com foco no LibreOffice/OpenOffice.org. Ele pode inserir diretamente citações e formatar o índice bibliográfico num documento aberto do OpenOffice.org Writer. As principais funcionalidades são:

• Organização hierárquica das referências com chaves definidas pelo usuário;
• Projetado para ambientes multi-usuário (compartilha bancos de dados entre usuários);
• Um motor de busca suportando consultas ao vivo;
• Acesso online ao PubMed;
• Importação de registros de PubMed (Medline), EndNote/Refer, RIS e BibTeX.

Bibus vai usar um banco de dados SQLite por padrão para armazenar (via o módulo SQLite3 disponível em Python >2.5). Mas ele também suporta bancos de dados MySQL. Se você quiser usar um banco de dados MySQL, certifique-se de que tem o pacote python-mysqldb instalado.

Converte entre os seguintes formatos de dados bibliográficos: BibTeX, COPAC, referência EndNote, EndNote XML, Pubmed XML, ISI web of science, MODS XML da Biblioteca do Congresso dos EUA, RIS, e bibliografia Word 2007.

Este pacote fornece as ferramentas de linha de comando bib2xml, copac2xml, end2xml endx2xml, isi2xml, med2xml, ris2xml que converte para o formato MODS XML, modsclean que reformata MODS XML, e um conjunto de comandos que combinam com o padrão xml2ads, xml2bib, xml2end, xml2isi, xml2ris, xml2wordbib que converte a partir do MODS XML.

cb2bib é um programa para extrair referências bibliográficas de fontes não formatadas e que não são padrão, como:

• alertas de e-mail;
• páginas web de periódicos;
• e, mais interessante ainda, de arquivos PDF.

As referências geradas são escritas em arquivos formatados para BibTeX. Outros recursos incluem:

• arquivos de artigos podem ser ligados e renomeados arrastando-os na janela do cb2Bib;
• editar e navegar por aquivos BibTeX;
• citar referências, pesquisar referência e o conteúdo completo dos documentos referenciados;
• inserir metadados bibliográficos nos documentos;
• escrever notas curtas para inter-relacionar várias referências.

Dia é um editor para diagramas, gráficos, tabelas etc. Há suporte para diagramas de estrutura estática UML (diagramas de classes), diagramas entidade-relacionamento, diagramas de rede e muito mais. Diagramas podem ser exportados para postscript e muitos outros formatos.

Debian GNU/Linux é amplamente usado em universidades para realização de pesquisas e para escrever papers com LaTeX. O pacote diploma contém exemplos que ilustram os caminhos possíveis para fazer isso efetivamente com Debian GNU/Linux. Cada exemplo é composto de uma árvore fonte em que você pode usar "make" no diretório de mais alto nível e então o código fonte é compilado, os dados de medidas são processados e os resultados são convertidos em boas figuras. Então o texto é processado e combinado com as figuras em um arquivo de impressão.

FeynMF é um pacote LaTeX para desenho fácil de diagramas de Feynman com qualidade profissional, ilustrações que mostram as interações fundamentais de partículas subatômicas. Os diagramas podem ser criados utilizando-se os programas Metafont ou MetaPost. FeynMF cria a maioria dos diagramas de maneira satisfatória a partir da estrutura do gráfico sem necessidade de intervenção manual. Contudo, todo o poder de Metafont e MetaPost está disponível para casos mais obscuros.

Note que será necessário o pacote texlive-metapost para que se possa usar a versão de FeynMF baseada em MetaPost.

Gummi is a LaTeX editor based on GTK3. The basic features are:

• Live preview pane for the compiled document,
• BibTeX integration,
• Helpers for tables and matrices,
• Exporting to PDF,
• Error checking,
• Syntax highlighting,
• Spellchecking,
• Document statistics,
• Persistent configuration.

A set of utilities for manipulating DSC compliant postscript. The following programs are included:

impose: A preprocessor to pstops for creating 2-up printouts. It tries to remove white space from the printout by probing the original postscript for the printed area's bounding box. This makes the output more esthetic than a simplistic layout of non-cropped original pages.

bboxx: Extracts the bounding boxes of a postscript file, with the option of entering the bounding box into the file. This program uses the ghostscript bbox device.

fixtd: Sets options in a Postscript file asking the printer to turn on tumbling or duplex printing.

psbl: Rearranges pages in a file to create booklets.

Ipe supports making small figures for inclusion into LaTeX documents as well as making multi-page PDF presentations Ipe's main features are:

• Entry of text as LaTeX source code. This makes it easy to enter mathematical expressions, and to reuse the LaTeX-macros of the main document. In the display text is displayed as it will appear in the figure.
• Produces pure Postscript/PDF, including the text. Ipe converts the LaTeX-source to PDF or Postscript when the file is saved.
• It is easy to align objects with respect to each other (for instance, to place a point on the intersection of two lines, or to draw a circle through three given points) using various snapping modes.
• Users can provide ipelets (Ipe plug-ins) to add functionality to Ipe. This way, Ipe can be extended for each task at hand.
• The text model is based on Unicode, and has been tested with Korean, Chinese, and Japanese.

Package lua5.3 is recommended if using Ipe with LaTeX.

Package texlive-latex-recommended enables unicode text entry (for accented characters).

Converts figures that were made with Ipe 5 to the format understood by Ipe 6. You can then run ipe6upgrade (from package ipe) to convert them to Ipe 7 format. Ipe is a drawing editor for creating figures, provided in package ipe.

JabRef é um aplicativo Java gráfico para editar bancos de dados BibTeX (.bib). JabRef permite organizar suas entradas em grupos lógicos sobrepostos, e com um único clique, permite limitar sua visão para um único grupo, ou para uma interseção ou união de vários grupos. Você pode personalizar as informações de entrada mostradas na janela principal, e classificar por qualquer um dos campos padrão do BibTeX. JabRef pode autogerar chaves BibTeX para suas entradas. JabRef também permite que você facilmente crie links de fontes PDF ou web para suas entradas de referência.

JabRef pode importar e exportar para vários formatos, e você pode personalizar filtros de exportação. JabRef pode ser executado como um aplicativo de linha de comando para converter de qualquer formato de importação para qualquer formato de exportação.

JEuclid is a complete MathML rendering solution, consisting of:

• A MathViewer application
• Command line converters from MathML to other formats
• An ant task for automated conversion
• Display components for AWT and Swing
• A component for Apache Cocoon

This package contains the Swing MathViewer application.

An application to manage bibliography databases in the BibTeX format. KBibTeX can be used as a standalone program, but can also be embedded into other KDE applications (e.g. as bibliography editor into Kile).

KBibTeX can query online resources (e.g. Google scholar) via customizable search URLs. It is also able to import complete datasets from NCBI Pubmed. It also supports tagging references with keywords and manages references to local files.

BibTeX files can be exported into HTML, XML, PDF, PS and RTF format using a number of citation styles.

Kile é um editor de código fonte LaTeX e shell TeX amigável para o KDE.

O Kile é um editor de código fonte multi-documento projetado para arquivos .tex e .bib. Menus, assistentes e auto-completação são fornecidos para auxiliar com inserção de tags e geração de código. Uma visão estrutural do documento auxilia na navegação dentro dos códigos fonte.

O shell TeX integra as várias ferramentas necessárias para o processamento TeX. Ele auxilia na compilação do LaTeX, visualização de documentos DVI e postscript, geração de bibliografia e índices e outras tarefas comuns.

Kile consegue suportar grandes projetos formados por vários arquivos pequenos.

latexdiff compara dois arquivos LaTeX e destaca as diferenças significativas (ou seja, um diff para arquivos LaTeX). Gera um novo arquivo LaTeX contendo as diferenças anotadas.

Várias opções estão disponíveis para marcação visual usando pacotes LaTeX padrão como, por exemplo, 'color.sty'. As alterações que não afetam diretamente o texto visível, por exemplo em comandos de formatação, ainda ficam marcadas na fonte LaTeX.

Uma interface rudimentar de revisão é fornecida por outro script Perl, "latexrevise", que aceita ou rejeita todas as mudanças. A edição manual do arquivo contendo as diferenças pode ser usada para anular este comportamento padrão e aceitar ou rejeitar somente as mudanças selecionadas.

JLaTeXmath library provides a set of Java classes for displaying (complex) mathematical formulas as part of a Java application. Some use cases are:

• Displaying text with embedded formulas (in an editor pane, a JavaHelp page, ...)
• Make a combo box which provides the user with a choice between various formulas.
• Have a slider with ticks that display their values not as decimal numbers, but as exact values, e.g., fractions, square roots or any combination of these.
• Display the formula together with the graph of a function.

LyX é uma interface quase WYSIWYG para LaTeX. Ele torna o poder e qualidade tipográfica do LaTeX disponível para pessoas que estão acostumadas a processadores de texto. Como o LyX suporta o conceito do LaTeX de marcadores genéricos, é até mais fácil e rápido criar documentos de qualidade profissional com ele do que com processadores de texto usuais. É também possível usar comandos LaTeX dentro do Lyx, assim nada do poder do LaTeX é perdido.

Você pode estender a funcionalidade do LyX instalando estes pacotes:

• chktex: verifica erros de digitação
• gnuhtml2latex: importa documentos HTML
• groff: formatação aprimorada de tabelas em exportações de texto puro
• gnumeric: importa planilhas
• librsvg2-bin, inkscape: usa o formato de imagem SVG em documentos LyX
• lilypond: suporte para partituras
• maxima: suporte integrado CAS para avaliação de equações
• mythes-*: usa o dicionário de sinônimos OpenOffice.org/LibreOffice
• noweb, r-cran-knitr: usa programação letrada (literate programming)
• rcs, cvs, svn, git: controle integrado de versões
• texlive-xetex/luatex: usa o sistema de editoração XeTeX/LuaTeX
• wv: importa documentos MS Word
• xsltproc (ou saxon com openjdk-17-jre), docbook-xl: exportação em ePub

Mlpost is an OCaml library for scientific drawing. It relies on Metapost, giving the possibility to include (La)TeX fragments. Mlpost users can use the full power of OCaml to generate their diagrams, including static typing and the possibility to use any OCaml library. Moreover, Mlpost promotes a declarative style quite different from existing tools.

This package contains a command-line tool to ease the generation of PostScript or PDF figures directly from .ml files.

Pandoc é uma biblioteca Haskell para conversão de um formato de marcação (markup) para outro, e uma ferramenta de linha de comando que usa essa biblioteca. Os formatos que ele pode manipular incluem:

• formatos de marcação leves (muitas variantes de Markdown, reStructuredText, AsciiDoc, Org-mode, Muse, Textile, txt2tags)
• formatos HTML (HTML 4 e 5)
• formatos de livro eletrônico (EPUB v2 e v3, FB2)
• formatos de documentação (GNU TexInfo, Haddock)
• formatos Roff (man, ms)
• formatos TeX (LaTeX, ConTeXt)
• Typst
• formatos XML (DocBook 4 e 5, JATS, TEI Simple, OpenDocument)
• formatos de Outline (OPML)
• formatos de bibliografia (BibTeX, BibLaTeX, CSL JSON, CSL YAML, RIS)
• formatos de processador de texto (Docx, RTF, ODT)
• formatos interativos de anotações (Jupyter notebook ipynb)
• formatos de layout de página (InDesign ICML)
• formatos de marcação wiki (MediaWiki, DokuWiki, TikiWiki, TWiki, Vimwiki, XWiki, ZimWiki, Jira wiki, Creole)
• formatos de apresentação de slides (LaTeX Beamer, PowerPoint, Slidy, reveal.js, Slideous, S5, DZSlides)
• formatos de dados (tabelas CSV e TSV)
• PDF (via programas externos como pdflatex ou wkhtmltopdf)

Pandoc pode converter conteúdo matemático em documentos entre TeX, MAthML, equações do Word, roff eqn, typst e texto puro. Inclui um sistema poderoso de citações e bibliografias automáticas, e pode ser extensivamente customizado usando modelos, filtros e leitores e gravadores customizados escritos em Lua.

Este pacote contém a ferramenta pandoc.

Alguns usos do Pandoc requerem pacotes adicionais:

• Conteúdo SVG em saída PDF requer librsvg2-bin.
• Metadados YAML em saída relacionada a TeX requer texlive-latex-extra.
• Filtros *.hs não definidos como executáveis requerem ghc.
• Filtros *.js não definidos como executáveis requerem nodejs.
• Filtros *.php não definidos como executáveis requerem php.
• Filtros *.pl não definidos como executáveis requerem perl.
• Filtros *.py não definidos como executáveis requerem python.
• Filtros *.rb não definidos como executáveis requerem ruby.
• Filtros *.r não definidos como executáveis requerem r-base-core.
• Saída LaTeX, e saída PDF via PDFLaTeX, requerem texlive-latex-recommended.
• Saída XeLaTeX, e saída PDF via XeLaTeX, requerem texlive-xetex.
• Saída LuaTeX, e saída PDF via LuaTeX, requerem texlive-luatex.
• Saída ConTeXt, e saída PDF via ConTeXt, requerem context.
• Saída PDF via wkhtmltopdf requer wkhtmltopdf.
• Saídas Roff man e roff ms, e saída PDF via roff ms, requerem groff.
• Equações processadas por MathJax requerem libjs-mathjax.
• Equações processadas por KaTeX requerem node-katex.
• opção --csl pode usar estilos em citation-style-language-styles.

pandoc-citeproc is a Haskell implementation of the Citation Style Language (CSL).

This package also contains an executable: pandoc-citeproc, which works as a pandoc filter (pandoc >= 1.12), and also has a mode for converting bibliographic databases a YAML format suitable for inclusion in pandoc YAML metadata.

Pybtex lê informações de citação de um arquivo e produz uma bibliografia formatada. Arquivos de estilo BibTeX são suportados. Alternativamente, é possível escrever estilos em Python.

Pybtex atualmente entende os seguintes formatos de bibliografia:

• BibTeX
• BibTeXML
• Formato baseado em YAML

A bibliografia resultante pode ser produzida em um dos seguintes formatos:

• LaTeX
• HTML
• texto puro

Este pacote fornece a interface de linha de comando.

Pybtex reads citation information from a file and produces a formatted bibliography. Pybtex-docutils provides a plugin which brings support for docutils to pybtex.

This package provides the modules for Python 3.

This extension allows BibTeX citations to be inserted into documentation generated by Sphinx, via a bibliography directive, and a cite role, which work similarly to LaTeX’s thebibliography environment and \cite command.

This package provides the modules for Python 3.

The R package knitr is a general-purpose literate programming engine, with lightweight API's designed to give users full control of the output without heavy coding work. It combines many features into one package with slight tweaks motivated from everyday use of Sweave.

The SageTeX LaTeX package allows you to embed code, results of computations, and plots from the SageMath mathematics software suite into LaTeX documents. SageMath is an open-source Computer Algebra System (CAS).

This package provides the LaTeX package.

Setzer features shortcuts for many LaTeX elements and symbols, a document creation wizard, a dark mode, a high screen to content ratio and a good side-by-side pdf viewer.

Sketch é um sistema simples para a produção de desenhos de linhas de objetos e cenas tridimensionais. Sketch procura produzir ilustrações delicadamente moldadas, baseadas em matemática, sem detalhes estranhos; e ser capaz de facilmente sobrepor texto e equações TeX. A linguagem de entrada é reminescente de PSTricks, portanto será fácil aprender por usuários de PSTricks. Ela gera saídas tanto em código PSTricks quanto TikZ/PGF.

Note que este pacote não é o programa de desenho de vetores interativo hoje conhecido como skencil.

A distribuição do software TeX Live oferece um sistema TeX completo. Abrange programas para composição tipográfica, pré-visualização e impressão de documentos TeX em diferentes idiomas, além de uma ampla coleção de macros TeX e bibliotecas de fontes. Este metapacote provê uma seleção satisfatória de pacotes do TeX Live que devem ser suficientes para as tarefas mais comuns. A distribuição também inclui uma extensa documentação geral do TeX, assim como a documentação que acompanha os pacotes de software inclusos.

Texmaker is a clean, highly configurable LaTeX editor with good hot key support and extensive LaTeX documentation. Texmaker integrates many tools needed to develop documents with LaTeX, in just one application. It has some nice features such as syntax highlighting, insertion of 370 mathematical symbols with only one click, and "structure view" of the document for easier navigation.

TeXstudio is an integrated writing environment for creating LaTeX documents. The software aims to simplify and enhance the LaTeX writing process, providing users with a range of features, including:

• Advanced syntax highlighting
• Live reference checking
• An integrated PDF viewer
• Live inline preview
• LaTeX command completion and syntax checking
• Local and global structure view
• Citations checking and completion
• Live grammar checking
• Spellchecking

vim-latexsuite attempts to provide a comprehensive set of tools to view, edit and compile LaTeX documents in Vim. Together, they provide tools starting from macros to speed up editing LaTeX documents to functions for forward searching .dvi documents.

This package also provides help to LaTeX in Vim.

By default, vim-latexsuite is not enabled. Please read /usr/share/doc/vim-latexsuite/README.Debian after installing the package.

XFig é uma ferramenta orientada a menus que possibilita ao usuário desenhar e manipular objetos interativamente em uma janela X. As imagens resultantes podem ser salvas. Se o programa fig2dev, que está no pacote fig2dev, estiver instalado, as figuras podem ser impressas em impressoras postscript ou convertidas para uma variedade de outros formatos (por exemplo, para possibilitar a inclusão em documentos LaTeX ou páginas web).

Este pacote contém o programa xfig propriamente dito.

Você deve considerar a instalação do pacote fig2dev para exportar gráficos para vários formatos comuns. Você deve considerar também a instalação do xfig-doc, que contém a documentação e o xfig-libs, que contém várias bibliotecas de clip art.

csv2latex is a simple command-line file converter that converts a comma-separated-values file into a LaTeX table. It can guess exotic csv formats.

GtkMathView is a C++ rendering engine for MathML documents. It provides an interactive view that can be used for browsing and editing MathML markup.

GtkMathView reads MathML documents by means of a frontend whose purpose is to traverse the MathML document (or part of it) and to appropriately instantiate GtkMathView's internal data structures that are suitable for rendering it. Currently the following frontends are supported: libxml2 (tree view using libxml2 API), libxml2 reader (event view using libxml2 reader API), GMetaDOM (tree view using DOM API), custom (application-specific view with application-provided callbacks).

GtkMathView renders MathML documents through a backend whose purpose is to provide an interface between the portable rendering engine and the platform-specific capabilities (like retrieving fonts, drawing on the screen, and so on). Currently the following backends are provided: GTK+, GTK+ widget, PostScript, SVG, AbiWord.

This package includes utilities to view and render MathML documents.

QTeXEngine enables Qt based applications to easily export graphics created using the QPainter class to TeX. It is built on top of QPaintEngine and uses the TikZ/Pgf graphic systems for TeX.

This package contains the development and header files for the QTeXEngine library.

This package integrates with LibreOffice to simplify the editing of mathematical and scientific formulas. It also allows you to use your favorite drawing software and include graphs of functions into a document.

This is a transitional package for luasseq to ensure proper upgrade to texlive-luatex. It can be safely removed after the installation is complete.

This GNU R package enables integration of base and grid graphics.

The GNU R package highr provides syntax highlighting for R source code; it natively supports generating LaTeX and HTML output from R source code. Source code of other languages is supported via Andre Simon's highlight package.

This GNU R package creates 'D3' 'JavaScript' scatterplots from 'R' with interactive features : panning, zooming, tooltips, etc.

The scatterD3 package provides an HTML widget based on the htmlwidgets package and allows one to produce interactive scatterplots by using the d3 javascript visualization library.

This GNU R package provides functions for plotting graphical shapes such as ellipses, circles, cylinders, arrows, ...

This R package provides functions returning, displaying or writing to disk the LaTeX or HTML code associated with the supplied object of class xtable. The package also provides functions converting an R object to an xtable object, which can then be printed as a LaTeX or HTML table.

Ipe is a drawing editor for creating figures, provided in package ipe.

This package contains a tool to convert drawings in SVG format to XML that can be used by ipe editor.

Tellico is a collection manager for KDE. It includes default collections for books, bibliographies, comic books, videos, music, coins, stamps, trading cards, and wines.

Tellico capabilities include:

• creation of user-defined custom collections with unlimited fields,
• automatically formatted names,
• sorting and filtering by any field or property,
• ISBN validation,
• full customization for printing or display through XSLT files,
• import and export of CSV, RIS, BibTeX and BibTeXML files,
• import data from Amazon, IMDb, CDDB or any US-MARC compliant z39.50 server.

Tellico files are stored in XML format, avoiding the need for a database server, and allowing other software applications to use the data.

pymarc is a Python library for working with MARC21 bibliographic data loosely based on the MARC/Perl suite of modules (http://marcpm.sf.net).

Quaneko is a tool that allows you to quickly search for keywords in the files and directories on the local hard disk. It creates indexes over the words in those files. For you, this means that a typical search query will only take seconds.

quaneko can not only search for words in plain text files but also in various other file formats, depending on its configuration (e.g. Word doc, pdf, html, xml,...)

Digital library manager. Think of it as an iTunes for your PDFs.