Debian Science typesetting packages

AUCTeX is a comprehensive customizable integrated environment for writing input files for TeX/LaTeX/ConTeXt/Texinfo using GNU Emacs.

It supports processing source files by running TeX and related tools (such as output filters, post processors for generating indices and bibliographies, and viewers) from inside Emacs. AUCTeX allows browsing through the errors reported by TeX, while it moves the cursor directly to the reported error, and displays some documentation for that particular error. This will even work when the document is spread over several files.

AUCTeX can automatically indent LaTeX source, either line by line or for an entire document, and has a special outline feature which can greatly assist in getting an overview of a document.

AUCTeX is written entirely in Emacs Lisp, and may therefore be enhanced with new features for specific needs. It comes with a large range of handy Emacs macros. It is a GNU project, and documentation for all its features is accessible via the Emacs info browser.

The biblatex package by Philipp Lehman is becoming the definitive citation management tool for LaTeX users. Biblatex has relied on the venerable BibTeX program only for sorting and generating a very generic .bbl file without any formatting instruction. Everything else is taken care of by biblatex, which provides a powerful and flexible macro interface for authors of citation styles.

Biber offers a large superset of BibTeX functionality for BibLaTeX users. In addition it offers full UTF-8 (Unicode 6.0) capabilities, fully customisable sorting, output to GraphViz to help visualise complex crossrefs, support for remote data sources, structural validation of the data against the (customisable) data model, and a lot more.

Bibus jest bibliograficzną bazą danych, zaprojektowaną z myślą o współpracy z LibreOffice/Openoffice.org. Umożliwia bezpośrednie wstawianie cytatów oraz formatowanie indeksu bibliograficznego do dokumentów Openoffice.org Writer. Główne zalety programu to:

• hierarchiczna organizacja odnośników zgodna z kluczami zdefiniowanymi przez użytkownika;
• zaprojektowanie pod kątem obsługiwania wielu użytkowników (współdzielenie baz danych pomiędzy użytkownikami);
• wyszukiwarka obsługująca wyszukiwanie w locie;
• dostęp on-line do PubMed;
• import rekordów z PubMed (Medline), EndNote/Refer, RIS oraz BibTeX.

Bibus domyślnie używa bazy danych SQLite (poprzez moduł SQLite3 dostępny w Pythonie > 2.5), jednak obsługuje również bazy danych MySQL. Aby obsługiwać bazy danych MySQL, należy zainstalować pakiet python-mysqldb.

Pakiet zapewnia możliwość konwersji między następującymi formatami danych bibliograficznych: BibTeX, COPAC, EndNote refer, EndNote XML, Pubmed XML, ISI web of science, Biblioteka Kongresu USA MODS XML, RIS i bibliografia Word 2007.

Pakiet zawiera następujące narzędzia wiersza poleceń: bib2xml, copac2xml, end2xml endx2xml, isi2xml, med2xml, ris2xml, które konwertują do formatu MODS XML, modsclean, który ponownie formatuje MODS XML, oraz dopasowany zestaw poleceń: xml2ads, xml2bib, xml2end, xml2isi, xml2ris, xml2wordbib, które konwertują z MODS XML.

Program cb2bib służy do wyodrębniania odnośników bibliograficznych z niesformatowanych i niestandardowych źródeł, takich jak:

• powiadomienia email;
• strony internetowe czasopism;
• i co najciekawsze pliki PDF.

Odniesienia wyjściowe są zapisywane w plikach w formacie BibTeX. Inne funkcje obejmują:

• pliki artykułów można łączyć i zmieniać ich nazwy, przeciągając je do okna cb2Bib;
• edytowanie i przeglądanie plików BibTeX;
• cytowanie referencji, wyszukiwanie referencji i pełnej treści powoływanych dokumentów;
• wstawianie metadanych bibliograficznych do dokumentów;
• pisanie krótkich notatek, które łączą ze sobą kilka odniesień.

Dia jest edytorem diagramów, wykresów, tabel itp. Obsługiwane są diagramy struktury statycznej UML (diagramy klas), diagramy relacji encji, diagramy sieciowe i wiele innych. Diagramy można eksportować do postscriptu i wielu innych formatów.

Debian GNU/Linux is widely used at universities to do research and to write papers with LaTeX. The package diploma contains examples which illustrate the possible ways to do this effectively with Debian GNU/Linux. Each example consists of a source tree where you can do "make" in the top level directory and then the source code is compiled, the measurement data are processed, and the results are converted into nice figures. Then the text is processed and combined with the figures to a print file.

FeynMF to pakiet LaTeX-a umożliwiający łatwe rysowanie diagramów Feynmana * profesjonalnej jakości. Diagramy Feynmana są ilustracjami, które wyraźnie pokazują podstawowe interakcje cząstek subatomowych. Diagramy można tworzyć za pomocą programów Metafont lub MetaPost. FeynMF w zadowalający sposób porządkuje większość diagramów w oparciu o ich strukturę, bez konieczności ręcznej interwencji. Niemniej jednak w nietypowych przypadkach dostępne są wszystkie opcje Metafont lub MetaPost.

Uwaga! Aby korzystać z wersji FeynMF opartej na MetaPost należy zainstalować pakiet texlive-metapost.

Gummi is a LaTeX editor based on GTK3. The basic features are:

• Live preview pane for the compiled document,
• BibTeX integration,
• Helpers for tables and matrices,
• Exporting to PDF,
• Error checking,
• Syntax highlighting,
• Spellchecking,
• Document statistics,
• Persistent configuration.

A set of utilities for manipulating DSC compliant postscript. The following programs are included:

impose: A preprocessor to pstops for creating 2-up printouts. It tries to remove white space from the printout by probing the original postscript for the printed area's bounding box. This makes the output more esthetic than a simplistic layout of non-cropped original pages.

bboxx: Extracts the bounding boxes of a postscript file, with the option of entering the bounding box into the file. This program uses the ghostscript bbox device.

fixtd: Sets options in a Postscript file asking the printer to turn on tumbling or duplex printing.

psbl: Rearranges pages in a file to create booklets.

Ipe wspiera tworzenie małych figur, które można dołączać do dokumentów LaTeX-a, a także tworzenie wielostronicowych prezentacji PDF. Główne cechy Ipe to:

• Wprowadzanie tekstu jako kodu źródłowego LaTeX-a. Ułatwia to wprowadzanie wyrażeń matematycznych i ponowne wykorzystanie makr LaTeX-a z głównego dokumentu. Na wyświetlaczu tekst jest wyświetlany tak, jak będzie wyglądał na rysunku.
• Tworzy czysty Postscript/PDF, w tym tekst. Ipe konwertuje plik źródłowy LaTeX-a na format PDF lub Postscript podczas zapisywania pliku.
• Ułatwia wyrównywanie obiektów względem siebie (na przykład umieszcza punkt na przecięciu dwóch linii lub rysuje okrąg przez trzy dane punkty) przy użyciu różnych trybów wykonywania grafik.
• Użytkownicy mogą udostępniać ipelety (wtyczki Ipe), aby dodawać funkcje do Ipe. W ten sposób można rozszerzyć Ipe, aby mogło wykonać każde zadanie.
• Model tekstowy jest oparty na Unicode i został przetestowany z językiem koreańskim, chińskim i japońskim.

Pakiet lua5.3 jest zalecany w przypadku używania Ipe z LaTeX-em.

Pakiet texlive-latex-recommended umożliwia wprowadzanie tekstu Unicode (w przypadku znaków akcentowanych).

Konwertuje figury wykonane za pomocą Ipe 5 do formatu zrozumiałego dla Ipe 6. Następnie można uruchomić ipe6upgrade (z pakietu ipe), aby przekonwertować je na format Ipe 7. Ipe to edytor rysunków do tworzenia figur, dostarczany w pakiecie ipe.

JabRef is a graphical Java application for editing BibTeX (.bib) databases. JabRef lets you organize your entries into overlapping logical groups, and with a single click limit your view to a single group or an intersection or union of several groups. You can customize the entry information shown in the main window, and sort by any of the standard BibTeX fields. JabRef can autogenerate BibTeX keys for your entries. JabRef also lets you easily link to PDF or web sources for your reference entries.

JabRef can import from and export to several formats, and you can customize export filters. JabRef can be run as a command line application to convert from any import format to any export format.

JEuclid is a complete MathML rendering solution, consisting of:

• A MathViewer application
• Command line converters from MathML to other formats
• An ant task for automated conversion
• Display components for AWT and Swing
• A component for Apache Cocoon

This package contains the Swing MathViewer application.

Aplikacja do zarządzania bibliograficznymi bazami danych w formacie BibTeX. KBibTeX może być używany jako niezależny program, lub też osadzony w innych aplikacjach KDE (np. jako edytor bibliograficzny w Kile).

KBibTeX może przeszukiwać zasoby online (np. Google Scholar) za pomocą konfigurowalnych adresów URL wyszukiwania. Umożliwia też importowanie kompletnych zestawów danych z NCBI Pubmed. Ponadto, obsługuje tagowanie odniesień za pomocą słów kluczowych i zarządza odniesieniami do plików lokalnych.

Pliki BibTeX mogą być eksportowane do formatu HTML, XML, PDF, PS i RTF przy użyciu wielu stylów cytowania.

Kile to przyjazny dla użytkownika edytor plików źródłowych LaTeX-a i powłoka TeX dla środowiska KDE.

Edytor plików źródłowych jest edytorem wielu dokumentów przeznaczonym dla plików .tex i .bib. Udostępnia menu, kreatory i automatyczne uzupełnianie, które ułatwiają wstawianie znaczników i generowanie kodu. Strukturalny widok dokumentu pomaga w poruszaniu się po plikach źródłowych.

Powłoka TeX integruje różne narzędzia wymagane do przetwarzania plików TeX-a. Pomaga kompilować teksty LaTeX-a, przeglądać dokumenty DVI i postscriptowe, generować bibliografie i indeksy oraz wykonywać inne typowe zadania.

Kile może obsługiwać duże projekty składające się z kilku mniejszych plików.

Latexdiff porównuje dwa pliki LaTeX-a i zaznacza znaczące różnice między nimi (tj. różnice dla plików LaTeX-a). Generuje nowy plik LaTeX-a zawierający różnice z adnotacjami.

Dostępne są różne opcje znaczników wizualnych przy użyciu standardowych pakietów LaTeX-a, takich jak "color.sty". Zmiany, które nie dotyczą bezpośrednio widocznego tekstu, na przykład w poleceniach formatowania, są nadal zaznaczane w pliku źródłowym LaTeX-a.

Podstawowe narzędzie do rewizji zapewnia inny skrypt Perla, "latexrevise", który akceptuje lub odrzuca wszystkie zmiany. Ręcznej edycji pliku różnic można użyć do zastąpienia tego domyślnego zachowania i zaakceptowania lub odrzucenia tylko wybranych zmian.

JLaTeXmath library provides a set of Java classes for displaying (complex) mathematical formulas as part of a Java application. Some use cases are:

• Displaying text with embedded formulas (in an editor pane, a JavaHelp page, ...)
• Make a combo box which provides the user with a choice between various formulas.
• Have a slider with ticks that display their values not as decimal numbers, but as exact values, e.g., fractions, square roots or any combination of these.
• Display the formula together with the graph of a function.

LyX is an almost WYSIWYG-frontend for LaTeX. It makes the power and typesetting quality of LaTeX available for people who are used to word processors. Since LyX supports LaTeX's concept of general mark-ups, it is even easier and faster to create professional quality documents with it than with usual word processors. It is also possible to use LaTeX commands within LyX, so nothing of LaTeX's power is lost.

You can extend the functionality of LyX by installing these packages:

• chktex: check for typographical errors
• gnuhtml2latex: import HTML documents
• groff: improved table formatting in plain text exports
• gnumeric: import spreadsheats
• librsvg2-bin, inkscape: use the SVG image format in LyX documents
• lilypond: support for musical sheets
• maxima: integrated CAS support for equation evaluation
• mythes-*: use the OpenOffice.org/LibreOffice Thesaurus
• noweb, r-cran-knitr: use literate programming
• rcs, cvs, svn, git: integrated version control
• texlive-xetex/luatex: use the XeTeX/LuaTeX typesetting system
• wv: import MS Word documents
• xsltproc (or saxon with openjdk-17-jre), docbook-xsl: ePub export

Mlpost jest biblioteką OCaml do naukowego rysowania. Opiera się on na MetaPost, umożliwiając dołączanie fragmentów (La)TeX-a. Użytkownicy Mlpost mogą korzystać z pełnej mocy OCaml przy generowaniu własnych diagramów, włącznie ze statycznym wpisywaniem i możliwością użycia dowolnej biblioteki OCaml. Ponadto Mlpost promuje deklaratywny styl różniący się od istniejących narzędzi.

Pakiet zawiera narzędzie wiersza poleceń, ułatwiające generowanie danych w formacie PostScript lub PDF bezpośrednio z plików .ml.

Pandoc is a Haskell library for converting from one markup format to another, and a command-line tool that uses this library. The formats it can handle include

• light markup formats (many variants of Markdown, reStructuredText, AsciiDoc, Org-mode, Muse, Textile, txt2tags)
• HTML formats (HTML 4 and 5)
• Ebook formats (EPUB v2 and v3, FB2)
• Documentation formats (GNU TexInfo, Haddock)
• Roff formats (man, ms)
• TeX formats (LaTeX, ConTeXt)
• Typst
• XML formats (DocBook 4 and 5, JATS, TEI Simple, OpenDocument)
• Outline formats (OPML)
• Bibliography formats (BibTeX, BibLaTeX, CSL JSON, CSL YAML, RIS)
• Word processor formats (Docx, RTF, ODT)
• Interactive notebook formats (Jupyter notebook ipynb)
• Page layout formats (InDesign ICML)
• Wiki markup formats (MediaWiki, DokuWiki, TikiWiki, TWiki, Vimwiki, XWiki, ZimWiki, Jira wiki, Creole)
• Slide show formats (LaTeX Beamer, PowerPoint, Slidy, reveal.js, Slideous, S5, DZSlides)
• Data formats (CSV and TSV tables)
• PDF (via external programs such as pdflatex or wkhtmltopdf)

Pandoc can convert mathematical content in documents between TeX, MathML, Word equations, roff eqn, typst, and plain text. It includes a powerful system for automatic citations and bibliographies, and it can be customized extensively using templates, filters, and custom readers and writers written in Lua.

This package contains the pandoc tool.

Some uses of Pandoc require additional packages:

• SVG content in PDF output requires librsvg2-bin.
• YAML metadata in TeX-related output requires texlive-latex-extra.
• *.hs filters not set executable requires ghc.
• *.js filters not set executable requires nodejs.
• *.php filters not set executable requires php.
• *.pl filters not set executable requires perl.
• *.py filters not set executable requires python.
• *.rb filters not set executable requires ruby.
• *.r filters not set executable requires r-base-core.
• LaTeX output, and PDF output via PDFLaTeX, require texlive-latex-recommended.
• XeLaTeX output, and PDF output via XeLaTeX, require texlive-xetex.
• LuaTeX output, and PDF output via LuaTeX, require texlive-luatex.
• ConTeXt output, and PDF output via ConTeXt, require context.
• PDF output via wkhtmltopdf requires wkhtmltopdf.
• Roff man and roff ms output, and PDF output via roff ms, require groff.
• MathJax-rendered equations require libjs-mathjax.
• KaTeX-rendered equations require node-katex.
• option --csl may use styles in citation-style-language-styles.

pandoc-citeproc is a Haskell implementation of the Citation Style Language (CSL).

This package also contains an executable: pandoc-citeproc, which works as a pandoc filter (pandoc >= 1.12), and also has a mode for converting bibliographic databases a YAML format suitable for inclusion in pandoc YAML metadata.

Pybtex odczytuje informacje o cytatach z pliku i tworzy sformatowaną bibliografię. Obsługuje pliki w stylu BibTeX. Alternatywnie umożliwia pisanie stylów w Pythonie.

Pybtex obecnie obsługuje następujące formaty bibliograficzne:

• BibTeX
• BibTeXML
• Format oparty na YAML

Powstała bibliografia może zostać wyświetlona w jednym z następujących formatów:

• LaTeX
• HTML
• Zwykły tekst

Pakiet zawiera interfejs wiersza poleceń.

Pybtex reads citation information from a file and produces a formatted bibliography. Pybtex-docutils provides a plugin which brings support for docutils to pybtex.

This package provides the modules for Python 3.

This extension allows BibTeX citations to be inserted into documentation generated by Sphinx, via a bibliography directive, and a cite role, which work similarly to LaTeX’s thebibliography environment and \cite command.

This package provides the modules for Python 3.

The R package knitr is a general-purpose literate programming engine, with lightweight API's designed to give users full control of the output without heavy coding work. It combines many features into one package with slight tweaks motivated from everyday use of Sweave.

The SageTeX LaTeX package allows you to embed code, results of computations, and plots from the SageMath mathematics software suite into LaTeX documents. SageMath is an open-source Computer Algebra System (CAS).

This package provides the LaTeX package.

Setzer features shortcuts for many LaTeX elements and symbols, a document creation wizard, a dark mode, a high screen to content ratio and a good side-by-side pdf viewer.

Sketch is a simple system for producing line drawings of three-dimensional objects and scenes. Sketch is intended to produce finely wrought, mathematically-based illustrations with no extraneous detail and be able to easily overlay TeX math and text. The input language is reminiscent of PSTricks, so will be easy to learn for current PSTricks users. It generates either PSTricks or TikZ/PGF code as output.

Note that this package is not the interactive vector drawing program now known as skencil.

The TeX Live software distribution offers a complete TeX system. It encompasses programs for typesetting, previewing and printing of TeX documents in many different languages, and a large collection of TeX macros and font libraries. . This metapackage provides a decent selection of the TeX Live packages which should suffice for the most common tasks. . The distribution also includes extensive general documentation about TeX, as well as the documentation accompanying the included software packages.

Texmaker is a clean, highly configurable LaTeX editor with good hot key support and extensive LaTeX documentation. Texmaker integrates many tools needed to develop documents with LaTeX, in just one application. It has some nice features such as syntax highlighting, insertion of 370 mathematical symbols with only one click, and "structure view" of the document for easier navigation.

TeXstudio is an integrated writing environment for creating LaTeX documents. The software aims to simplify and enhance the LaTeX writing process, providing users with a range of features, including:

• Advanced syntax highlighting
• Live reference checking
• An integrated PDF viewer
• Live inline preview
• LaTeX command completion and syntax checking
• Local and global structure view
• Citations checking and completion
• Live grammar checking
• Spellchecking

Pakiet vim-latexsuite zawiera obszerny zestaw narzędzi do przeglądania, edytowania i kompilowania dokumentów LaTeX-a z edytora Vim, poczynając od makr przyśpieszających modyfikowanie dokumentów LaTeX-a, a na funkcjach przeszukujących zawartość plików .dvi kończąc.

Pakiet zawiera również pliki pomocy odnośnie LaTeX-a do edytora Vim.

W domyślnej konfiguracji vim-latexsuite nie jest włączony. Proszę przeczytać /usr/share/doc/vim-latexsuite/README.Debian po zainstalowaniu pakietu.

XFig jest sterowanym za pomocą menu narzędziem, które pozwala użytkownikowi na interaktywne rysowanie i zarządzanie obiektami w systemie X Window. Powstałe rysunki można zapisywać. Jeśli zainstalowany jest program fig2dev, który jest zawarty w pakiecie fig2dev, zdjęcia można drukować na drukarkach postscriptowych lub konwertować na wiele innych formatów (np. aby umożliwić integrację z dokumentami LaTeXa lub stronami internetowymi).

Pakiet zawiera sam program XFig.

Warto pomyśleć o zainstalowaniu pakietu transfig, umożliwiającego eksportowanie plików graficznych do wielu popularnych formatów. Ponadto można zainstalować zawierający dokumentację pakiet xfig-doc oraz pakiet xfig-libs, dostarczający kilka bibliotek z gotowymi rysunkami (ang. clip art).

Program csv2latex to prosty, działający w wierszu poleceń konwerter plików, który konwertuje plik z wartościami rozdzielanymi przecinkami na tabelę LaTeX-a. Obsługuje egzotyczne formaty CSV.

GtkMathView is a C++ rendering engine for MathML documents. It provides an interactive view that can be used for browsing and editing MathML markup.

GtkMathView reads MathML documents by means of a frontend whose purpose is to traverse the MathML document (or part of it) and to appropriately instantiate GtkMathView's internal data structures that are suitable for rendering it. Currently the following frontends are supported: libxml2 (tree view using libxml2 API), libxml2 reader (event view using libxml2 reader API), GMetaDOM (tree view using DOM API), custom (application-specific view with application-provided callbacks).

GtkMathView renders MathML documents through a backend whose purpose is to provide an interface between the portable rendering engine and the platform-specific capabilities (like retrieving fonts, drawing on the screen, and so on). Currently the following backends are provided: GTK+, GTK+ widget, PostScript, SVG, AbiWord.

This package includes utilities to view and render MathML documents.

QTeXEngine enables Qt based applications to easily export graphics created using the QPainter class to TeX. It is built on top of QPaintEngine and uses the TikZ/Pgf graphic systems for TeX.

This package contains the development and header files for the QTeXEngine library.

Pakiet ten integruje się z LibreOffice, aby uprościć edycję formuł matematycznych i naukowych. Umożliwia także korzystanie z ulubionego oprogramowania do rysowania i dołączanie wykresów funkcji do dokumentu.

This is a transitional package for luasseq to ensure proper upgrade to texlive-luatex. It can be safely removed after the installation is complete.

This GNU R package enables integration of base and grid graphics.

The GNU R package highr provides syntax highlighting for R source code; it natively supports generating LaTeX and HTML output from R source code. Source code of other languages is supported via Andre Simon's highlight package.

This GNU R package creates 'D3' 'JavaScript' scatterplots from 'R' with interactive features : panning, zooming, tooltips, etc.

The scatterD3 package provides an HTML widget based on the htmlwidgets package and allows one to produce interactive scatterplots by using the d3 javascript visualization library.

Jest to pakiet GNU R, który zapewnia funkcje do rysowania kształtów graficznych, takich jak: elipsy, okręgi, cylindry, strzałki itd.

This R package provides functions returning, displaying or writing to disk the LaTeX or HTML code associated with the supplied object of class xtable. The package also provides functions converting an R object to an xtable object, which can then be printed as a LaTeX or HTML table.

Ipe is a drawing editor for creating figures, provided in package ipe.

This package contains a tool to convert drawings in SVG format to XML that can be used by ipe editor.

Tellico is a collection manager for KDE. It includes default collections for books, bibliographies, comic books, videos, music, coins, stamps, trading cards, and wines.

Tellico capabilities include:

• creation of user-defined custom collections with unlimited fields,
• automatically formatted names,
• sorting and filtering by any field or property,
• ISBN validation,
• full customization for printing or display through XSLT files,
• import and export of CSV, RIS, BibTeX and BibTeXML files,
• import data from Amazon, IMDb, CDDB or any US-MARC compliant z39.50 server.

Tellico files are stored in XML format, avoiding the need for a database server, and allowing other software applications to use the data.

pymarc is a Python library for working with MARC21 bibliographic data loosely based on the MARC/Perl suite of modules (http://marcpm.sf.net).

Quaneko is a tool that allows you to quickly search for keywords in the files and directories on the local hard disk. It creates indexes over the words in those files. For you, this means that a typical search query will only take seconds.

quaneko can not only search for words in plain text files but also in various other file formats, depending on its configuration (e.g. Word doc, pdf, html, xml,...)

Digital library manager. Think of it as an iTunes for your PDFs.