Debian Science Tools packages

HDF Compass est un programme expérimental de visualisation pour les formats HDF5 et apparentés, conçu pour compléter d’autres applications plus complexes comme HDFView. Un accent fort a été placé sur une conception minimale épurée et une extensibilité maximale à l’aide d’un système de greffons pour de nouveaux formats.

Ce paquet fournit l’application HDF Compass.

A photogrammetry toolkit that provides improved methods for making and using camera models (calibration, tracking, mapping, etc). The focus is on calibration and uncertainty propagation to produce the most accurate models possible. This package provides the user-facing tools

Il s’agit d’une application de bureau écrite en Java pour créer des autostéréogrammes, rendus populaires par le livre « Magic Eye ». Des images peuvent être créées qui paraissent surgir en 3D lorsqu’elles sont regardées en louchant (cross-eyed ou wall-eyed, vision parallèle).

Il s’agit d’une interface de Python pour le format de fichier netCDF4, qui lit et écrit des fichiers HDF5, locaux ou distants, directement à l’aide de h5py oo h5pyd, sans s’appuyer sur la bibliothèque netCDF d’Unidata.

Ce paquet fournit les modules pour Python⋅3.

HDF5 pour Python (h5py) est une interface Python généraliste pour la bibliothèque Hierarchical Data Format, version 5. HDF5 est une bibliothèque polyvalente, scientifiquement mature, conçue pour un stockage rapide et flexible d'énormes quantités de données.

Du point de vue d'un programmeur Python, HDF5 offre une manière robuste de stocker des données, organisées par nom sous forme arborescente. Des bases de données peuvent être créées (baies de stockage) de centaines de gigaoctets et effectuer des accès E/S aléatoires dans les sections désirées. Les jeux de données sont organisés dans une hiérarchie de type système de fichiers en utilisant des conteneurs appelés « groupes », et auxquels l’accès se fait en utilisant la syntaxe traditionnelle POSIX /chemin/vers/ressource.

H5py fournit une interface simple, robuste en lecture/écriture, pour les données HDF5 à partir de Python. Les concepts existants de Python et Numpy sont utilisés pour l'interface ; par exemple, les jeux de données sur le disque sont représentés par une classe mandataire qui gère le transfert de sous-ensembles (slicing) et qui possède les attributs dtype et shape. Les groupes HDF5 sont présentés en utilisant la métaphore d'un dictionnaire, indexés par nom.

Ce paquet est un paquet simple de dépendance qui dépend de la construction série ou MPI de h5py et fournit les fichiers de test de données.

hdf5plugin provides h5py extensions to control HDF5 compression filters plugins installed in the system.

The package supports providing options to: * blosc * bitshuffle * lz4 * FCIDECOMP * ZFP * zstd

These filter plugins are not provided by this package and need to be installed using their own packages.

This package provides high level utilities to read/write a variety of Python types to/from HDF5 (Heirarchal Data Format) formatted files. This package also provides support for MATLAB MAT v7.3 formatted files, which are just HDF5 files with a different extension and some extra meta-data.

This package provides hdf5storage for the Python 3 interpreter.

pybind11 is a lightweight header library that exposes C++ types in Python and vice versa, mainly to create Python bindings of existing C++ code. Its goals and syntax are similar to the excellent Boost.Python library by David Abrahams: to minimize boilerplate code in traditional extension modules by inferring type information using compile-time introspection.

This package provides pybind11 for Python 3.

ReproZip is a tool aimed at simplifying the process of creating reproducible experiments from command-line executions, a frequently-used common denominator in computational science.

It tracks operating system calls and creates a package that contains all the binaries, files and dependencies required to run a given command on the author’s computational environment (packing step). A reviewer can then extract the experiment in his environment to reproduce the results (unpacking step).

This package provides the ReproZip unpacker.

ReproZip is a tool aimed at simplifying the process of creating reproducible experiments from command-line executions, a frequently-used common denominator in computational science.

It tracks operating system calls and creates a package that contains all the binaries, files and dependencies required to run a given command on the author’s computational environment (packing step). A reviewer can then extract the experiment in his environment to reproduce the results (unpacking step).

This package provides the ReproZip packer.

This task lists some packages providing workflow management systems useful for scientific research.

Xoscope is a oscilloscope using input from a sound card or EsounD server and/or a COMEDI hardware. Includes 8 signal displays, variable time scale, math, memory, measurements, and file save/load.

Memtailor is a C++ library of special purpose memory allocators. It currently offers an arena allocator and a memory pool.

This package contains the developer tools.

A photogrammetry toolkit that provides improved methods for making and using camera models (calibration, tracking, mapping, etc). The focus is on calibration and uncertainty propagation to produce the most accurate models possible. This package provides the development C libraries

The MapReduce-MPI (MR-MPI) library is open-source software that implements the MapReduce operation popularized by Google on top of standard MPI message passing.

The MR-MPI library is written in C++ and is callable from hi-level languages such as C++, C, Fortran. A Python wrapper is also included, so MapReduce programs can be written in Python, including map() and reduce() user callback methods. A hi-level scripting interface to the MR-MPI library, called OINK, is also included which can be used to develop and chain MapReduce algorithms together in scripts with commands that simplify data management tasks. OINK has its own manual and doc pages.

This package contains development files needed to build MapReduce-MPI applications.

A photogrammetry toolkit that provides improved methods for making and using camera models (calibration, tracking, mapping, etc). The focus is on calibration and uncertainty propagation to produce the most accurate models possible. This package provides the Python interfaces

The project provides descriptions for most user-mode x86, x86-64, and k1om instructions up to AVX-512 and SHA (including 3dnow!+, XOP, FMA3, FMA4, TBM and BMI2).

This package installs the library for Python 3.

Pweave est un générateur de rapport scientifique et un outil de programmation lettrée pour Python. Pweave peut capturer le résultat et réaliser des tracés à partir d’analyse de données et fonctionne parfaitement avec NumPy, SciPy et matplotlib. Il peut exécuter du code Python à partir d’un document source et inclure le résultat et les tracés matplotlib dans sa sortie.

L’utilisation d’une souris ou d’une boule de commande est laborieuse pour les applications en 3D : il manque une dimension, et plus encore si une distinction doit être faite entre l’inclinaison et le déplacement ou la réalisation des deux opérations en même temps, comme ce qui est fait intuitivement avec une tasse de café. 3Dconnexion produit des périphériques de saisie à six degrés de liberté, vendus comme « space navigator », « space pilot », « space traveller », « space mouse », etc., et l’acquisition d’un de ces produits conduit vraisemblablement à l’abandon de la souris et à regretter tout le temps perdu à positionner des objets en CAD/CAM ou ailleurs.

Spacenavd est un logiciel ouvert de remplacement de pilote en espace utilisateur (démon) pour ces périphériques. Il est compatible avec le démon propriétaire original 3dxsrv fourni par 3Dconnexion, et fonctionne parfaitement avec n’importe quel programme écrit pour le pilote de 3Dconnexion. Il propose aussi une autre méthode d’accès au périphérique à l’aide d’un protocole nouveau non dépendant de X11.

skinedit is the skin editor that accompanies TiEmu, the Texas Instruments calculators emulator. By using a different skin, you change the appearance of the emulator.

skinedit can handle VTi (another emulator, running on Windows) skins too, allowing you to convert the skins between the VTi formats and the TiEmu format.

Pydap is an implementation of the Opendap/DODS protocol, written from scratch. You can use Pydap to access scientific data on the internet without having to download it; instead, you work with special array and iterable objects that download data on-the-fly as necessary, saving bandwidth and time. The module also comes with a robust-but-lightweight Opendap server, implemented as a WSGI application.

This package provides the modules for Python 3.