Summary
Tools
Debian Science generic tools for scientific work
This task lists Debian Science some packages which are providing some
generic tools for sciences and to enhance scientific work.
Note that there is no according metapackage created since the packages
might be to different to make sense to install all on one machine.
Description
For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:
If you discover a project which looks like a good candidate for Debian Science
to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to
send a description of that project to the Debian Science mailing list
Links to other tasks
|
Debian Science Tools packages
Official Debian packages with high relevance
hdf-compass
Fremviser for HDF4 og relaterede formater
|
Versions of package hdf-compass |
Release | Version | Architectures |
stretch | 0.6.0-1 | all |
sid | 0.7~b15-1 | all |
trixie | 0.7~b15-1 | all |
bookworm | 0.7~b8-3 | all |
bullseye | 0.7~b8-3 | all |
buster | 0.6.0-1 | all |
|
License: DFSG free
|
HDF Compass er et eksperimentelt fremviserprogram for HDF5 og relaterede
formater, designet til at komplementere andre mere komplekse programmer
såsom HDFView. Stærk vægt er lagt på et rent minimalt design og
maksimal mulighed for udvidelse via et system for udvidelsesmoduler for nye
formater.
Denne pakke tilbyder HDF Compass-programmet.
|
|
mrcal
Kalibrering og SFM-bibliotek
|
Versions of package mrcal |
Release | Version | Architectures |
bookworm | 2.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
trixie | 2.4.1-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
sid | 2.4.1-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
|
License: DFSG free
|
Et fotogrammetrisk værktøjssæt der tilbyder forbedrede metoder til at lave og bruge kameramodeller (kalibrering, registrering, oversættelse etc.). Fokus er på kalibrering og usikkerhedsudbredelse for at fremstille de mest præcise mulige modeller. Denne pakke tilbyder de brugerrettede værktøjer.
|
|
openstereogram
Stereogram ("Magic Eye") generator with GUI
|
Versions of package openstereogram |
Release | Version | Architectures |
sid | 0.1+20080921-3 | all |
trixie | 0.1+20080921-3 | all |
bookworm | 0.1+20080921-3 | all |
stretch | 0.1+20080921-2 | all |
bullseye | 0.1+20080921-3 | all |
|
License: DFSG free
|
A desktop application written in Java to generate autosterograms,
made popular through the book "Magic Eye." Users create images which appear
to pop out in 3D when looked at cross-eyed or wall-eyed (parallel vision).
|
|
python3-h5netcdf
NetCDF4-understøttelse via h5py for Python 3
|
Versions of package python3-h5netcdf |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 0.8.1-2 | all |
sid | 1.4.0-3 | all |
bookworm | 1.1.0-1 | all |
trixie | 1.4.0-3 | all |
upstream | 1.4.1 |
|
License: DFSG free
|
En Pythongrænseflade for netCDF4-filformatet, der læser og skriver lokale eller eksterne HDF5-filer direkte via h5py eller h5pyd, uden at afhænge af Unidata netCDF-biblioteket.
Denne pakke tilbyder modulerne for Python 3.
|
|
python3-h5py
Almene Pythongrænseflader til hdf5
|
Versions of package python3-h5py |
Release | Version | Architectures |
sid | 3.11.0-8 | all |
trixie | 3.11.0-5 | all |
stretch | 2.7.0-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 2.2.1-1.1 | amd64,armel,armhf,i386 |
buster | 2.8.0-3 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 2.10.0-9 | all |
bookworm | 3.7.0-8 | all |
upstream | 3.12.1 |
|
License: DFSG free
|
HDF5 for Python (h5py) er en almen Pythongrænseflade til Hierarchical Data
Format-biblioteket, version 5. HDF5 er et alsidigt, modent videnskabeligt
programbibliotek designet for hurtig, fleksibel lagring af enorme mængder
af data.
Fra en Pythonprogrammørs perspektiv så tilbyder HDF5 en robust måde at
lagre data, organiseret efter navn i en trælignende metode. Du kan oprette
datasæt (tabeller på disk) på hundredvis af gigabyte i størrelse og udføre
vilkårlig-adgang I/O på ønskede sektioner. Datasæt er organiseret i et
filsystemlignende hierarki, der bruger containere kaldt »grupper« og
tilgået via den traditionelle POSIX /sti/til/ressource-syntaks.
H5py tilbyder en simpel, robust læs/skriv grænseflade til HDF5-data fra
Python. Eksisterende Python- og Numpy-koncepter bruges for grænsefladen;
for eksempel er datasæt repræsenteret af en proxyklasse, som understøtter
opdeling og har dtype- og shape-attributter. HDF5-grupper præsenteres via
en ordbogsmetafor, indekseret efter navn.
Dette er en simpel afhængighedspakke, der afhænger af den serielle bygning eller MPI-bygningen af h5py samt tilbyder filer med testdata.
|
|
python3-hdf5plugin
Python library to make HDF5 compression filters usable from h5py
|
Versions of package python3-hdf5plugin |
Release | Version | Architectures |
trixie | 4.0.1-3 | all |
sid | 4.0.1-3 | all |
bookworm | 4.0.1-3 | all |
|
License: DFSG free
|
hdf5plugin provides h5py extensions to control HDF5 compression filters
plugins installed in the system.
The package supports providing options to:
* blosc
* bitshuffle
* lz4
* FCIDECOMP
* ZFP
* zstd
These filter plugins are not provided by this package and need to be installed
using their own packages.
|
|
python3-hdf5storage
high-level utilities to read from and write to HDF5 (Python 3)
|
Versions of package python3-hdf5storage |
Release | Version | Architectures |
sid | 0.1.19-2 | all |
bookworm | 0.1.19-1 | all |
stretch | 0.1.14-1 | all |
trixie | 0.1.19-2 | all |
|
License: DFSG free
|
This package provides high level utilities to read/write a variety of Python
types to/from HDF5 (Heirarchal Data Format) formatted files. This package also
provides support for MATLAB MAT v7.3 formatted files, which are just HDF5 files
with a different extension and some extra meta-data.
This package provides hdf5storage for the Python 3 interpreter.
|
|
python3-pybind11
Pybind11-hjælpemodul for Python 3
|
Versions of package python3-pybind11 |
Release | Version | Architectures |
trixie | 2.13.6-1 | all |
sid | 2.13.6-1 | all |
bookworm | 2.10.3-1 | all |
bullseye | 2.6.2-1 | all |
stretch | 2.0.1-3 | all |
buster | 2.2.4-2 | all |
|
License: DFSG free
|
Pybind11 er et simpelt teksthovedbibliotek, der aktiverer C++-typer i Python og omvendt, hovedsagelig for at oprette Pythonbindinger for eksisterende C++-kode. Dets formål og syntaks svarer til det glimrende Boost.Python-bibliotek af David Abrahams_ at minimere boilerplate-kode i traditionelle udvidelsesmoduler ved at nedarve typeinformation via introspektion på kompileringstidspunktet.
Denne pakke tilbyder pybind11 for Python 3.
|
|
reprounzip
Værktøj til at reproducere videnskabelige eksperimenter - udpakker
|
Versions of package reprounzip |
Release | Version | Architectures |
trixie | 1.3-2 | all |
bullseye | 1.0.16-2 | all |
bookworm | 1.0.16-2 | all |
sid | 1.3-2 | all |
buster | 1.0.10-1 | all |
|
License: DFSG free
|
ReproZip er et værktøj rettet mod at forenkle processen med at oprette
reproducerbare eksperimenter fra kørsler på kommandolinjen, en ofte anvendt
fælles nævner indenfor beregningsvidenskab.
Værktøjet registrerer systemkald fra operativsystemet og opretter en pakke,
som indeholder alle de binære filer, filer og afhængigheder krævet for at
afvikle en given kommando på forfatterens beregningsmiljø (pakketrin). En
korrekturlæser kan så udtrække eksperimentet i sit miljø for at genskabe
resultaterne (udpakningstrin).
Denne pakke tilbyder udpakkeren ReproZip.
|
|
reprozip
Værktøj til at reproducere videnskabelige eksperimenter - pakkeprogram
|
Versions of package reprozip |
Release | Version | Architectures |
sid | 1.3-2 | amd64,i386 |
bullseye | 1.0.16-1 | all |
buster | 1.0.14-2 | all |
bookworm | 1.1-2 | all |
|
License: DFSG free
|
ReproZip er et værktøj rettet mod at forenkle processen med at oprette
reproducerbare eksperimenter fra kørsler på kommandolinjen, en ofte anvendt
fælles nævner indenfor beregningsvidenskab.
Værktøjet registrerer systemkald fra operativsystemet og opretter en pakke,
som indeholder alle de binære filer, filer og afhængigheder krævet for at
afvikle en given kommando på forfatterens beregningsmiljø (pakketrin). En
korrekturlæser kan så udtrække eksperimentet i sit miljø for at genskabe
resultaterne (udpakningstrin).
Denne pakke tilbyder pakkeprogrammet ReproZip.
|
|
science-workflow
Håndteringssystem til arbejdsforløb der er nyttig i videnskabelig forskning
|
Versions of package science-workflow |
Release | Version | Architectures |
trixie | 1.14.6 | all |
stretch | 1.7 | all |
buster | 1.10 | all |
bullseye | 1.14.2 | all |
bookworm | 1.14.5 | all |
sid | 1.14.6 | all |
|
License: DFSG free
|
Denne opgave viser nogle pakker, der tilbyder håndteringssystemer for
arbejdsforløb, der er nyttige i videnskabelig forskning.
|
|
xoscope
|
Versions of package xoscope |
Release | Version | Architectures |
stretch | 2.2-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 2.0-3.2 | amd64,armel,armhf,i386 |
sid | 2.3-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
buster | 2.2-1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 2.2-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 2.3-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
Debtags of package xoscope: |
field | electronics |
interface | x11 |
role | program |
use | checking, learning |
x11 | application |
|
License: DFSG free
|
Xoscope er et oscilloskop, der bruger inddata fra et lydkort eller EsounD-
server og/eller COMEDI-udstyr. Inkluderer 8 signalenheder, variabel
tidsskala, matematik, hukommelse, målinger og gem/hent fil.
|
|
Official Debian packages with lower relevance
libmemtailor-dev
C++-bibliotek for specielle hukommelsesmålere - udviklerværktøjer
|
Versions of package libmemtailor-dev |
Release | Version | Architectures |
bookworm | 1.0~git20220104-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bullseye | 1.0~git20200526-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.0~git20160311-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 1.0~git20160302-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 1.0~git20230916-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
trixie | 1.0~git20230916-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
|
License: DFSG free
|
Memtailer er et C++-bibliotek med specielle hukommelsesmålere. Biblioteket
tilbyder i øjeblikket en arena-måler og en hukommelseskø.
Denne pakke indeholder udviklerværktøjerne.
|
|
libmrcal-dev
Kalibrering og SFM-bibliotek
|
Versions of package libmrcal-dev |
Release | Version | Architectures |
sid | 2.4.1-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bookworm | 2.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
trixie | 2.4.1-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
|
License: DFSG free
|
Et fotogrammetrisk værktøjssæt der tilbyder forbedrede metoder til at lave og bruge kameramodeller (kalibrering, registrering, oversættelse etc.). Fokus er på kalibrering og usikkerhedsudbredelse for at fremstille de mest præcise mulige modeller. Denne pakke tilbyder C-bibliotekerne for udvikling.
|
|
libmrmpi-dev
Implements MapReduce operation on top of standard MPI message - development
|
Versions of package libmrmpi-dev |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 1.0~20140404-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 1.0~20140404-1 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 1.0~20140404-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.0~20140404-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bookworm | 1.0~20140404-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
trixie | 1.0~20140404-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
sid | 1.0~20140404-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
Debtags of package libmrmpi-dev: |
devel | library |
role | devel-lib |
|
License: DFSG free
|
The MapReduce-MPI (MR-MPI) library is open-source software that implements the
MapReduce operation popularized by Google on top of standard MPI message
passing.
The MR-MPI library is written in C++ and is callable from hi-level languages
such as C++, C, Fortran. A Python wrapper is also included, so MapReduce
programs can be written in Python, including map() and reduce() user callback
methods. A hi-level scripting interface to the MR-MPI library, called OINK, is
also included which can be used to develop and chain MapReduce algorithms
together in scripts with commands that simplify data management tasks. OINK has
its own manual and doc pages.
This package contains development files needed to build MapReduce-MPI
applications.
|
|
python3-mrcal
Kalibrering og SFM-bibliotek
|
Versions of package python3-mrcal |
Release | Version | Architectures |
sid | 2.4.1-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
trixie | 2.4.1-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bookworm | 2.2-4 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
|
License: DFSG free
|
Et værktøjssæt for fotogrammetri der tilbyder forbedrede metoder til at lave og bruge kameramodeller (kalibrering, registrering, oversættelse etc.). Fokus er på kalibrering og udbredelse af usikkerhed for at fremstille de mest præcise modeller muligt. Denne pakke tilbyder Pythongrænsefladerne.
|
|
python3-opcodes
Database for processorinstruktioner/-Opcodes - Python 3
|
Versions of package python3-opcodes |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 0.0~git20180424.6e2b0cd-3 | all |
bookworm | 0.0~git20180424.6e2b0cd-3 | all |
trixie | 0.0~git20180424.6e2b0cd-3 | all |
sid | 0.0~git20180424.6e2b0cd-3 | all |
upstream | 0.0~git20240108.b606dde |
|
License: DFSG free
|
Projektet tilbyder beskrivelser for de fleste brugertilstands x86-, x86-64- og k1om-instruktioner op til AVX-512 og SHA (inklusive 3dnow!+, XOP, FMA3, FMA4, TBM og BMI2).
Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.
|
|
python3-pweave
Videnskabelig rapportopretter for Python
|
Versions of package python3-pweave |
Release | Version | Architectures |
trixie | 0.30.3-1 | all |
buster | 0.25-1 | all |
bullseye | 0.25-3 | all |
bookworm | 0.30.3-1 | all |
sid | 0.30.3-1 | all |
|
License: DFSG free
|
Pweave er en videnskabelig rapportopretter og et bogstaveligt programmeringsværktøj for Python. Pweave kan optage resultaterne og plotte fra dataanalyse og fungerer godt med NumPy, SciPy og matplotlib. Kan afvikle Pythonkode fra kildedokument og inkluderer resultaterne og optager matplotlib-plot i resultatet.
|
|
spacenavd
Dæmon for brug af 3D-inddataenheder fra 3Dconnexion
|
Versions of package spacenavd |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 0.7.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 1.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 0.5-1 | amd64,armel,armhf,i386 |
trixie | 1.2-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
sid | 1.2-3 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
stretch | 0.6-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
Debtags of package spacenavd: |
hardware | input |
interface | daemon |
role | program |
|
License: DFSG free
|
En normal computermus eller rullebold er besværlig at bruge for 3D-programmer - en dimension mangler, flere hvis man ønsker at skelne vipning fra bevægelse eller ønsker at udføre begge operationer på samme tid.
Spacenavd er et frit programudviklingssæt og en brugerrumsdriver (dæmon), for disse enheder. Den er kompatibel med den originale proprietære dæmon tilbudt af 3Dconnexion og virker perfekt med alle programmer skrevet for 3Dconnexion-driveren. Den tilbyder også en anden metode til at tilgå enheden via en ny ikke-X11-afhængig protokol.
|
|
tiemu-skinedit
Temaredigeringsværktøj til TiEmu
|
Versions of package tiemu-skinedit |
Release | Version | Architectures |
sid | 1.28~git20220826.cda2db4-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
trixie | 1.28~git20220826.cda2db4-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bookworm | 1.28~git20220826.cda2db4-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bullseye | 1.28~20200818-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.27-3 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 1.27-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 1.27-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
upstream | 1.28~git20240908.2b8df92 |
Debtags of package tiemu-skinedit: |
hardware | emulation |
interface | x11 |
role | program |
scope | application |
uitoolkit | gtk |
use | editing |
x11 | application |
|
License: DFSG free
|
Skinedit er et temaredigeringsværktøj der følger med TiEmu, Texas
Instruments-emulatoren. Ved at benytte et andet tema, ændrer du emulatorens
udseende.
Skinedit kan også håndtere VTi-overflader (VTi er en anden emulator, der
kører på Windows), hvilket tillader dig at konvertere temaerne mellem
VTi-formaterne og TiEmu-formatet.
|
|
Packaging has started and developers might try the packaging code in VCS
python3-pydap
implementation of the Data Access Protocol in Python
|
Versions of package python3-pydap |
Release | Version | Architectures |
VCS | 3.2.2+ds1-1 | all |
|
License: Expat
Debian package not available
Version: 3.2.2+ds1-1
|
Pydap is an implementation of the Opendap/DODS protocol, written from scratch.
You can use Pydap to access scientific data on the internet without having to
download it; instead, you work with special array and iterable objects that
download data on-the-fly as necessary, saving bandwidth and time. The module
also comes with a robust-but-lightweight Opendap server, implemented as a WSGI
application.
This package provides the modules for Python 3.
|
|