Debian Science High Energy Physics packages

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

Este meta-pacote fornece quase todos os programas e bibliotecas contidos no CERNLIB. A maioria das pessoas provavelmente só precisará de um subconjunto desses. Alguns programas extra CERNLIB, que não são do interesse de várias pessoas, podem ser obtidos através do meta-pacote cernlib-extras.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

Este pacote inclui uma miscelânea de arquivos independentes de arquitetura úteis para os programas e bibliotecas CERNLIB, incluindo um script de exemplo de como gerar uma estrutura de diretórios modelo para o CERNLIB e macros de realce de sintaxe no Vim para arquivo KUIPC CDF e arquivos de macro PAW "kumac".

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

Este metapacote fornece as biblioteca e as ferramentas de análise (e.g. PAW) que provavelmente serão de interesse da maioria dos usuários das bibliotecas CERN que não estão interessados especificamente em física de altas energias. Ele não fornece ferramentas ou bibliotecas de desenvolvimento; essas podem ser obtidas instalando o metapacote cernlib-core-dev ou os pacotes lib*-dev individualmente.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

Este metapacote fornece algumas programas CERNLIB adicionais que não são incluídos em qualquer outro pacote CERNLIB. Pouquíssimas pessoas estarão interessadas neles; atualmente eles incluem zftp, pawserv e zserv. Os dois últimos programas funcionam como daemons através do inetd e podem levantar preocupações sobre a segurança do sistema.

Instalar este pacote juntamente com o metapacote 'cernlib' fornecerá um conjunto completo de todos os programas e bibliotecas CERNLIB, exceto aqueles que não estão incluídos no Debian por razões de licenciamento.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

Este metapacote fornece várias bibliotecas Monte Carlo incluídas no CERNLIB (tanto compartilhadas quanto estáticas). Provavelmente somente físicos se interessarão nestes pacotes. Note que a infra-estrutura GEANT 3.21 não está incluída, mas pode ser obtida instalando o pacote Debian geant321.

Esteja ciente que as bibliotecas de Ariadne, Fritiof, Jetset, Lepto, e Pythia não estão disponíveis no Debian devido a problemas de licenciamento; veja o arquivo README.Debian no pacote montecarlo-base para informações sobre como obtê-las.

The DIALS software is developed in a fully open-source, collaborative environment. The main development teams are based at Diamond Light Source and CCP4, in the UK, and at Lawrence Berkeley National Laboratory, USA. However, in the spirit of the open source movement, we welcome collaboration from anyone who wishes to contribute to the project.

To avoid “reinventing the wheel” as much as possible, the DIALS project builds on knowledge accumulated over many decades in the field of crystallographic data processing. We benefit greatly from the altruism of experts who contribute their ideas and advice, either directly or via their detailed publications on existing algorithms and packages such as XDS [2] and MOSFLM [3]. At the heart of the DIALS framework lies a design philosophy of hardware abstraction and a generalised model of the experiment that is inspired directly by material published on the seminal workshops on position sensitive detector software [1]. Continuing in the spirit of these workshops we held our own series of meetings, with talks from invited speakers, and code camps in which specific problems are addressed by intensive effort across the collaboration. Summaries of these meetings and copies of slides given as presentations are available here.

DIALS is written using Python and C++, making heavy use of the cctbx [4] for core crystallographic calculations and much infrastructure including a complete build system. Seamless interaction between the C++ and Python components of this hybrid system is enabled by Boost.Python. Python provides a useful ground for rapid prototyping, after which core algorithms and data structures may be transferred over to C++ for speed. High level interfaces of the hybrid system remain in Python, facilitating further development and code reuse both within DIALS and by third parties.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

DZedit é uma interface interativa para o sistema DZDOC (ZEBRA documentation) desenvolvido no CERN. ZEBRA, parte da biblioteca Packlib, permite a criação de estruturas de dados complexas na linguagem FORTRAN 77; * sistema DZDOC ajuda a gerar e manter a documentação para estruturas de dados ZEBRA.

FeynMF é um pacote LaTeX para desenho fácil de diagramas de Feynman com qualidade profissional, ilustrações que mostram as interações fundamentais de partículas subatômicas. Os diagramas podem ser criados utilizando-se os programas Metafont ou MetaPost. FeynMF cria a maioria dos diagramas de maneira satisfatória a partir da estrutura do gráfico sem necessidade de intervenção manual. Contudo, todo o poder de Metafont e MetaPost está disponível para casos mais obscuros.

Note que será necessário o pacote texlive-metapost para que se possa usar a versão de FeynMF baseada em MetaPost.

GEANT é uma infra-estrutura para simular a passagem de partículas subatômicas através da matéria, como por exemplo, detectores de partículas. Para maior flexibilidade, as simulações do GEANT são executadas ligando o código FORTRAN fornecido pelo usuário com a biblioteca GEANT, então é rodado o executável resultante.

Este pacote inclui o gxint, um script que faz esta ligação um pouco mais conveniente.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para utilização em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

KUIPC, o kit para um compilador de pacote de interface de usuário, é um pacote para simplificar a escrita do código de interface de usuário de um programa. É preciso um arquivo de definição de comando (CDF) como entrada que descreve os comandos que devem ser compreendidos pelo programa, e código de saída em C ou FORTRAN que gera chamadas de funções apropriadas para configurar a interface do usuário. Este código pode ser compilado e vinculado com o restante do programa. Uma vez que o código gerado utiliza rotinas KUIP, o programa também deve ser vinculado com a biblioteca Packlib que os contém.

KUIPC não é mais desenvolvido ativamente, então, além da sua utilização no processo de construção do CERNLIB, é principalmente de interesse histórico.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

KXterm é um emulador de terminal que combina as melhores funcionalidades dos (agora em "defunct") Apollo DM pads (como: entrada e transcrição "pads", backup de arquivos de "transcript pad", busca de strings em "pads", etc.) e a edição e os mecanismos de "recall" de linha de comando no estilo emacs do Korn shell. Ele pode suportar a interface em linha de comando de várias aplicações CERNLIB.

LoopTools is a package for evaluation of scalar and tensor one-loop integrals based on the FF package by G.J. van Oldenborgh. It features an easy Fortran, C++, and Mathematica interface to the scalar one-loop functions of FF and in addition provides the 2-, 3-, and 4-point tensor coefficient functions.

This package provides program file, lt, of LoopTools.

NEURON is a simulation environment for modeling individual neurons and networks of neurons. It provides tools for conveniently building, managing, and using models in a way that is numerically sound and computationally efficient. It is particularly well-suited to problems that are closely linked to experimental data, especially those that involve cells with complex anatomical and biophysical properties.

NEURON offers

• "natural syntax", which allows one to specify model properties in familiar idioms
• efficient and painless spatial and temporal discretization
• several different, user-selectable numerical integration methods
• convenient user interface (interpreters + GUI)
• user-extendable library of biophysical mechanisms

CERNLIB is a suite of data analysis tools and libraries created for use in physics experiments, but also with applications to other fields such as the biological sciences.

This package contains the Nypatchy family of programs, the successors to Patchy and Ypatchy. These programs are intended for working with sets of patches (for instance, for use on different machine architectures) meant to be applied to a source code tree. The patch sets and common source code are maintained as a single text-based Patchy Master file (PAM file). PAM files can contain C, FORTRAN, or assembly code.

Nypatchy and related utilities can perform actions on a PAM file such as updating it; comparing it to an older version; or outputting source code suitable for input to a compiler, having selected some subset of available patches to use. These utilities can be used interactively, or can run in batch mode from a "cradle" file of commands.

While Nypatchy is still used in places, mainly high-energy physics, these programs are no longer under active development. They are not recommended for use in new projects.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

PAW é um programa interativo que fornece ferramentas de análise matemática e estatística e apresentação gráfica interativa. Ele é desenhado para trabalhar em objetos familiares a físicos como histogramas, arquivos de eventos (Ntuples), vetores, etc.

O programa está estaticamente ligado com as bibliotecas CERN em arquiteturas 64-bit para que possa funcionar corretamente, pois seu projeto não é muito elegante para 64-bit.

CERNLIB is a suite of data analysis tools and libraries created for use in physics experiments, but also with applications to other fields such as the biological sciences.

This package includes Paw++, an interactive program for use in analysis and graphical presentation. Paw++ is the same program as PAW (in the "paw" package), but with a more user-friendly Motif-based GUI, compiled against Lesstif in Debian.

The program is linked statically against the CERN libraries on 64-bit architectures in order to function properly, as its design is not very 64-bit clean.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações em outros campos como o de ciências biológicas.

Este pacote contém o daemon de servidor para clientes PAW remotos. PAW é o Physics Analysis Workstation (Estação de análise física), um programa de análise gráfica. Incluso no mesmo binário está o zserv, o daemon de servidor para o protocolo ZFTP; zserv é um programa de transferência de arquivos extensível por extensões que suporta a transferência de arquivos formatados, não-formatados e ZEBRA RZ (CMZ, HBOOK, etc.). Ele é similar a um daemon FTP normal, embora ele ouça em uma porta diferente. Ambos os servidores operam através do inetd.

Uma vez que estes servidores aceitam senhas em texto plano e não suportam SSL ou outro método de criptografia, você provavelmente vai querer instalar este pacote numa LAN confiável. Ele deve ser visto como um equivalente do vanilla telnetd em termos de segurança (ou ausência dela).

SDPB is an open-source, arbitrary-precision, parallelized semidefinite program solver, designed for the conformal bootstrap. SDPB significantly outperforms less specialized solvers and should enable many new computations.

For more information, see "A Semidefinite Program Solver for the Conformal Bootstrap" at http://arxiv.org/abs/1502.02033.

CERNLIB is a suite of data analysis tools and libraries created for use in physics experiments, but also with applications to other fields such as the biological sciences.

ZFTP is a macro-extensible file transfer program which supports the transfer of formatted, unformatted and ZEBRA RZ files (CMZ, HBOOK, etc.). It provides a common interface on all systems and avoids the problems of file format conversion that occur when transferring CERNLIB files between different architectures.

Except for the special treatment of CERNLIB files and use of a different port, zftp is very similar to an FTP client. Unless you are already familiar with this program, it will almost certainly be useless to you.

GEANT is a framework for simulating the passage of subatomic particles through matter, for instance, particle detectors. For maximum flexibility, GEANT simulations are performed by linking FORTRAN code supplied by the user with the GEANT library, then running the resulting executable.

This package includes some documentation in text format about GEANT 3.21.

CERNLIB é uma suite de bibliotecas e ferramentas de análise de dados criada para uso em experimentos físicos, mas também com aplicações de outros campos como o de ciências biológicas.

Este pacote inclui scripts de exemplo para uso pelo PAW ou Paw++, e scripts de teste para ter certeza de que os programas PAW ou Paw++ estão se comportando corretamente. Você pode executar os exemplos e testes com o programa paw-demos que está incluído na suite.

Geant4 is a toolkit for the simulation of the passage of particles through matter. Its areas of application include high energy, nuclear and accelerator physics, as well as studies in medical and space science.

This is a metapackage depending on all libraries.