PAN Blend xas packages

IFEFFIT è un programma interattivo per analisi XAFS. Combina gli algoritmi di analisi di alta qualità di AUTOBK e FEFFIT con visualizzazione grafica di dati XAFS e manipolazione di dati generica.

IFEFFIT viene fornito come programma a riga di comando, ma la funzionalità sottostante è disponibile come una libreria di programmazione. La libreria IFEFFIT può essere usata da programmi C, Fortran, Tcl e Perl.

PyMca è un insieme di applicazioni e librerie Python per l'analisi di spettri di fluorescenza a raggi X.

Le applicazioni incluse in questo pacchetto sono:

• edfviewer - visualizzazione e ispezione di file di dati in ESRF Data Format;
• elementsinfo - visualizza dati di raggi X specifici di un elemento;
• mca2edf - converte un file dal formato SPEC MCA a EDF;
• peakidentifier - visualizza picchi di fluorescenza a raggi X in un dato intervallo di energia;
• pymcabatch - fitting non interattivo di spettri;
• pymcapostbatch - post-elaborazione dei risultati del fitting non interattivo;
• pymca - analisi interattiva dei dati;
• pymcaroitool - strumento per immagini Region-of-interest (ROI).

Il toolkit PyMca può leggere file di dati nei formati SPEC, ESRF data file (EDF), OMNIC, HDF5, AIFIRA e SupaVisio.

Questi sono gli script del pacchetto.

Larch is a library and set of applications for processing and analyzing X-ray absorption and fluorescence spectroscopy data and X-ray fluorescence and diffraction image data from synchrotron beamlines.

Larch is especially focussed on X-ray absorption fine-structure spectroscopy (XAFS) including X-ray absorption near-edge spectroscopy (XANES) and extended X-ray absorption fine-structure spectroscopy (EXAFS). It also supports visualization and analysis tools for X-ray fluorescence (XRF) spectra and XRF and X-ray diffraction (XRD) images as collected at scanning X-ray microprobe beamlines.

This package installs the larch module and scripts for Python 3.

• GSE MapViewer for GSECARS X-ray microprobe data.
• Larch CLI and Gtk GUI.
• XAS Viewer for XAFS Processing and Analysis.
• XRF Display to display and analyze XRF Spectra.

The Larch CLI is available as larch_cli in Debian.

Quantum ESPRESSO (prima chiamato PWscf) è una suite integrata di sorgenti per calcoli di strutture elettroniche e modellazione di materiali alla nanoscala. È basato sulla teoria del funzionale densità, sulle onde piane e sui pseudopotenziali (sia a norma conservata, sia ultrasoft, sia PAW).

Tra le funzionalità vi sono:

• calcoli dello stato fondamentale e della struttura delle bande tramite sollecitazioni, forze ed energie totali autocoerenti di onde piane;
• pseudopotenziali a norma conservata e ultrasoft (Vanderbilt) separabili, PAW (Projector Augmented Waves);
• vari funzionali di scambio e correlazione, dalla LDA alle approssimazioni di gradiente generalizzato (PW91, PBE, B88-P86, BLYP) fino a funzionali meta-GGA, di scambio esatto (HF) e ibridi (PBE0, B3LYP, HSE);
• dinamica molecolare Car-Parrinello e Born-Oppenheimer;
• ottimizzazione strutturale che include stati di transizione e percorsi ad energia minima;
• magnetismo non collineare e accoppiamento spin-orbita;
• proprietà di risposta che includono frequenze di fononi e autovettori, cariche efficaci e tensori dielettrici, sezioni d'urto Raman ed infrarossi, spostamenti chimici EPR e NMR;
• proprietà spettroscopiche come l'eccitazione elettronica e le righe K ed L1 nello spettro di assorbimento ai raggi X (XAS, X-ray Absorption Spectra).

ATHENA è un'utilità grafica interattiva per l'elaborazione di dati EXAFS. Fa la maggior parte dei comuni lavori di gestione dei dati, inclusi deglitching, allineamento, unione, rimozione dello sfondo e trasformate di Fourier.

ARTEMIS è un'utilità grafica interattiva per il fit di dati EXAFS usando standard teorici da FEFF e per creazione di modelli sofisticati dai dati insieme ad una visualizzazione e ad un'analisi statistica flessibili.

HEPHAESTUS è una tavola periodica potenziata per chi fa spettroscopia XAS; fornisce svariate utilità che hanno a che fare con tabelle dei coefficienti di assorbimento ed altri dati chimici.

Visualization of contextual data (energy and polarization of the line, resolution, sample and spectrometer positions) Processing of CCD images to extract RIXS spectra: application of thresholds, extraction of the curvature (by Gaussian fit) necessary to sum the CCD lines after linear interpolation. Visualization of the RIXS spectra and construction of RIXS maps in two representations: Emission Energy and Energy Loss.