Debian Science Viewing packages

Ce programme fournit une interface graphique pour l'analyse scientifique de données de point de valeurs réelles (valeurs x, y, z). Il a pour cible principalement les applications de sondes atomiques tomographiques mais peut être utile à d'autres applications.

camv-rnd est un afficheur modulaire de format de fichier de FAO (principalement PCB) pour la CAO qui prend en charge gerber, excellon et g-code. L’interface graphique propose zoom, panoramique et mesures sur plusieurs couches de plusieurs fichiers.

Ctioga2 est un programme de tracé dans l’esprit de gnuplot. Il peut être utilisé soit directement en ligne de commande, ou en écrivant un fichier de commandes (ou un mélange des deux). Il produit des fichiers PDF de qualité professionnelle. Il est basé sur la bibliothèque de tracé Tioga.

Ctioga2 est une complète réécriture de ctioga et est conçu pour le remplacer dans un avenir pas si lointain.

Il s’agit d’un frontal en ligne de commande, adaptable pour Gnuplot. Il crée des tracés à partir de données fournies sur l’entrée standard ou par un nom de fichier indiqué sur la ligne de commande. Différentes représentations des données sont prises en charge, ainsi que l’impression de la sortie ou l’affichage du flux de données en temps réel.

Fityk est un programme flexible et portable pour la régression non linéaire de fonctions analytiques (spécialement celles en forme de pic) pour des données (habituellement des données expérimentales) – en d’autres mots pour le tri et l’analyse non linéaire.

Il a été développé pour l’analyse de modèles de diffraction, mais peut être aussi utilisé dans d’autres domaines, car les opérations et les concepts particuliers à la cristallographie sont séparés du reste du programme.

Fityk propose diverses méthodes de régression non linéaire, détection d’arrière-plan, calibration de données, positionnement aisé des pics et modifications de leurs paramètres, automatisation des tâches courantes avec des scripts et bien d’autres choses encore. Le principal avantage de ce programme est sa souplesse – les paramètres des pics peuvent être de manière arbitraire reliés les uns aux autres, par exemple, la largeur d’un pic peut être une variable indépendante, la même que celle d’un autre pic ou peut être donnée par une formule compliquée commune à tous les pics.

Libjs-sphinxdoc est nécessaire pour les éléments en Javascript dans la documentation.

g3data est utilisé pour extraire des données de graphiques. Par exemple, des graphiques sont généralement publiés dans des journaux scientifiques sans les tables de données. g3data effectue la tâche d'extraire ces données facilement.

geg est un utilitaire très simple pour analyser et représenter graphiquement des fonctions 2D comme par exemple f(x) = 3 + sin(x), ou évidemment des fonctions bien plus complexes. Il est écrit avec Gtk+ et propose une interface utilisateur soignée et personnalisable.

Gerris est un système pour résoudre des équations différentielles partielles décrivant un écoulement de fluide.

GfsView affiche le résultat de simulations avec Gerris en 2D et 3D. Bref résumé de ses caractéristiques principales :

 — sections scalaires et vectorielles ;
 — isosurfaces ;
 — lignes de courant ;
 — fonctions personnalisées ;
 — affichage adaptatif rapide (en utilisant la représentation de données
   multi-résolution de Gerris) ;
 — « scriptabilité »;
 — génération autonome d’image ;
 — sorties de qualité PostScript, PDF et matricielle.

Giza is a lightweight scientific plotting library built on top of cairo that provides uniform output to multiple devices. Giza also provides a mostly compatible, modern replacement for the PGPLOT graphics library.

This package contains the development files.

GLE est un langage de script pour graphiques conçu pour la création de figures telles que tableaux, tracés, graphiques, et diagrammes d'un niveau de qualité digne de publication. Il prend en charge divers types de tableaux (y compris tracé de fonction, histogramme, graphique à barres, diagramme de dispersion, tracé de contours, carte couleur et tracé de surfaces) à l'aide d'une simple mais flexible ensemble de commandes de dessin. Des sorties plus complexes peuvent être créées en s'appuyant sur son langage de script, très complet avec ses sous-routines, variables et contrôle logique.

GLE s'appuie sur LaTeX pour les sorties texte et prend en charge les formules mathématiques dans les graphiques et tableaux. Les formats de sortie incluent (E)PS, PDF, JPEG et PNG.

Gmsh est un générateur de grille 3D d'éléments finis, muni d'un moteur de CAD intégré et d’un post-processeur. Il a été conçu pour fournir un outil de maillage, rapide léger et facile à utiliser avec des entrées paramétriques et des capacités avancées de visualisation. Gmsh est construit autour de quatre modules : géométrie, maillage, solveur et post-processeur. La spécification d'une donnée à ces modules est faite soit de manière interactive en utilisant l'interface utilisateur graphique, soit dans des fichiers texte en ASCII utilisant le langage de script propre à Gmsh.

Consultez le manuel de référence de Gmsh pour une vue d'ensemble plus complète des possibilités offertes par Gmsh.

GNU Data Language (GDL) est un compilateur incrémental libre compatible avec IDL (Interactive Data Language). Sa syntaxe est entièrement compatible avec IDL 7.1. IDL est une marque déposée d’ITT Visual Information Solutions. À partir de IDL 8.0, les éléments de langage suivants sont pris en charge :

 — boucle FOREACH ;
 — indices de tableau négatifs ;
 — ramasse-miettes pour les pointeurs et objets ;
 — méthodes d’appel sur des objets en utilisant « . » (par exemple,
   `object.aMemberProcedure,arg1`).

Le système d’entrée et sortie de fichiers est complètement implémenté. La prise en charge de l’interface graphique (composants graphiques) est officiellement fournie, mais pas encore finie.

Ce paquet fournit le frontal de l’interpréteur en ligne de commande.

Gnuplot est un utilitaire de tracé de données et de fonctions en ligne de commande qui prend en charge de nombreux formats de sortie, dont les pilotes pour de nombreuses imprimantes, (La)Tex, (x)fig, Postscript, etc. La version X11 est empaquetée dans gnuplot-x11.

Les fichiers de données et les fonctions définies par l'utilisateur peuvent être manipulés avec le langage interne de gnuplot (type langage C). Gnuplot peut effectuer des lissages, des régressions linéaires ou non linéaires (par splines notamment) et peut travailler avec les nombres complexes.

Ce métapaquet permet d’installer gnuplot avec toutes ses possibilités (-qt, -x11 ou -nox).

Grace est un outil de pointage-cliquage permettant à l’utilisateur de dessiner des graphiques X-Y. Il s’agit du programme précédemment connu comme Xmgr.

Quelques-unes de ses caractéristiques sont : mise à l’échelle définie par l’utilisateur, marques de graduation, étiquettes, symboles, styles de ligne, couleurs, régression polynomiale, cerces (spline), moyenne mobile, transformation de Fourier discrète et rapide, corrélation croisée ou automatique, traitement par lots pour un tracé automatique et prise en charge de l’impression pour PostScript, FrameMaker et plusieurs formats d’image.

Le dessin de graphes aborde le problème de la visualisation d'informations structurées par la construction de représentations géométriques de schémas abstraits et de réseaux. La génération automatique de graphes a d'importantes applications dans certaines technologies clés comme la conception de base de données, l'ingénierie logicielle, la conception VLSI et réseau ou encore les interfaces graphiques, dans d'autres domaines. Les situations dans lesquelles ces outils peuvent être particulièrement utiles sont :

- Vous voulez restructurer un programme, mais vous devez d'abord comprendre les relations entre types, procédures et fichiers source ; - Vous devez identifier les goulets d'étranglement dans une dorsale Internet - les liens individuels et leurs relations ; - Vous devez déboguer un protocole ou une micro-architecture représentée par une machine à états finis et vous avez besoin de comprendre comment certains états d'erreur se produisent ; - Vous voulez naviguer dans un schéma de base de données, une base de connaissances, ou un programme distribué représentés graphiquement ; - Vous voulez avoir une représentation graphique d'un ensemble de documents liés ; - Vous voulez découvrir des types et des centres d'intérêts communs dans une base de données d'appels téléphoniques ou de messages électroniques.

Ce paquet contient les outils en ligne de commande.

Gri est un langage libre pour la programmation de graphiques scientifiques. Il est piloté en ligne de commande, à l’opposé du pointer/cliquer. Certains utilisateurs considèrent que Gri est similaire à LaTeX puisque les deux sont extrêmement puissants, et récompensent le fait d’endurer une phase d'apprentissage. La sortie est conforme au standard PostScript professionnel et adaptée pour l'inclusion dans d'autres documents.

Gri peut générer des graphiques x-y, des tracés ou des images. Un contrôle fin est fourni sur tous les aspects du dessin, par exemple les largeurs de ligne, les couleurs, les fontes, etc. Les lettres grecques et les symboles mathématiques sont disponibles en utilisant une syntaxe qui ressemble à celle de TeX.

Ceux qui écrivent des scripts Gri de 1000 lignes commencent habituellement avec quelque chose d'aussi simple que :

 open file.dat       # ouverture d’un fichier
 read columns x * y  # lecture de 1ère colonne en tant que x et la 3ème en
                     # tant que y
 draw curve          # tracé des données et mise à l’échelle automatique
                     # des axes

Un manuel complet est disponible au format HTML (paquet gri-html-doc), au format PDF adéquat pour l'impression (paquet gri-pdf-doc) et sur le web en suivant les liens à la page d’accueil de Gri : http://gri.sourceforge.net/

Gwyddion est un programme modulaire pour la visualisation et l’analyse des données de microscopie à sonde locale (SPM – Scanning Probe Microscopy). Il est principalement conçu pour l’analyse des données du champ de hauteur obtenues par des techniques telles que (entre autres) :

 – le microscope à force atomique (AFM – Atomic Force Microscopy) ;
 – le microscope à force magnétique (MFM – Magnetic Force Microscopy) ;
 – le microscope à effet tunnel (STM – Scanning Tunneling Microscopy) ;
 – le microscope optique en champ proche (SNOM ou NSOM – Near-field
   Scanning Optical Microscopy).
Il peut aussi être utilisé pour n’importe quelle analyse de champ de

hauteur et d’image.

Ce paquet fournit l'application principale et ses modules. Il contient également un générateur d'aperçu pour GNOME (et Xfce) permettant de créer des aperçus pour tous les types de fichier pris en charge par Gwyddion.

Imview est une application qui :

• affiche un grand nombre de formats d'images ;
• affiche des images 2D ou 3D (en tranches) avec une fonctionalité de zoom ;
• fonctionne pour des documents multi-spectre, animés ou multi-pages (par exemple : images satellites, piles TIFF, GIFs animés et fichiers multi-composants hétérogènes) ;
• affiche tous les types de pixels (données entières ou en virgule flottante, codées sur 1 à 64 bits) ;
• permet d'afficher des profils 1D quelconques d'images 2D (ou des tranches 2D d'images 3D) ;
• supporte des cartes de couleurs quelconques pour tous types de pixels (i.e. : affichage en fausses couleurs) ;
• fournit les outils classiques de manipulation d'images (luminosité/contraste, correction gamma, zoom, retaillage, rotation, etc.) ;
• peut être contrôlé à distance à travers des sockets ou des commandes texte (ce qui permet de l'intégrer facilement dans différents systèmes d'analyse d'images) ;
• peut charger les images depuis une socket ou un espace de mémoire partagée ;
• et bien plus encore !

Kst est un outil de tracé et de visualisation, rapide et en temps réel, de grands ensembles de données. Il possède les fonctionnalités basiques d’analyse de données, beaucoup de fonctions internes puissantes et est extensible avec des greffons ou des extensions.

LabPlot fournit un moyen de créer, gérer et d’éditer des tracés de données. Il permet de produire des tracés à partir de données de feuille de calcul ou importées de fichiers externes. Les tracés peuvent être exportés dans plusieurs formats de graphismes matriciels ou vectoriels.

 .
Ses fonctionnalités incluent :
 – gestion des données par projet ;
 – explorateur de projet pour la gestion et l’organisation des objets créés
   dans différents dossiers ou sous-dossiers ;
 – feuille de calcul avec les fonctions de base pour la saisie manuelle des
   données ou pour la génération de nombres aléatoires uniformes ou non ;
 – importation de données ASCII externes dans le projet pour une édition et
   visualisation ultérieures ;
 – exportation de feuille de calcul dans un fichier ASCII ;
 – feuille de travail comme objet parent principal pour des tracés, des
   étiquettes, etc., prise en charge de différentes mises en page et de
   fonctions d’agrandissement ;
 – export de feuille de travail dans différents formats (PDF, EPS, PNG
   et SVG) ;
 – grande variété de possibilités d’édition des propriétés de feuille de
   travail et d’objet ;
 – tracés cartésiens créés soit à partir de données importées ou créées
   manuellement, soit à l’aide d’équations mathématiques ;
 – définition de formule mathématique gérée par coloration
   syntaxique et complétion, et par la liste, groupées par thème, de
   constantes et fonctions mathématiques et physiques ;
 – analyse des tracés prise en charge par de nombreuses fonctions de zoom
   et navigation ;
 – ajustements aux données linéaires ou non, plusieurs modèles
   d’ajustements prédéfinis et possibilité de modèles usuels avec un nombre
   arbitraire de paramètres.

This interface allows gnuplot to be controlled from C++ and is designed to be the lowest hanging fruit. In other words, if you know how gnuplot works it should only take 30 seconds to learn this library. Basically it is just an iostream pipe to gnuplot with some extra functions for pushing data arrays and getting mouse clicks. Data sources include STL containers (eg. vector or map) and one or two dimensional Blitz++ arrays (of scalars or TinyVectors). Support for other data sources should be easy to add.

Basically there are two functions defined: send() sends arrays of data values (it is overloaded to do the right thing based upon what type of variable you pass) and getMouse() gets the position of a mouse click. Everything else is accomplished by sending commands manually to gnuplot via the iostream interface.

Lybniz est un traceur de fonction avec une interface graphique simple. Il peut actuellement tracer trois fonctions et permet de naviguer dans le tracé. Les fonctions sont entrées en notation Python ou de type C.

Il s’agit d’une bibliothèque, libre et multi-plateforme, de routines C++ rapides pour un tracé de données jusqu’en trois dimensions. Elle peut exporter les graphiques dans des fichiers matriciels ou vectoriels EPS, SVG ou IDTF. Ces routines sont de simples interfaces graphiques basées sur GLUT, FLTK ou Qt. MathGL peut être aussi utilisé en console. Il existe des interfaces pour quelques langages comme C, Fortran, Pascal, Forth, Python ou Octave.

Ce paquet fournit des utilitaires et des exemples de MathGL.

matlab2tikz est un script d’Octave pour convertir des figures d’Octave en figures natives de TikZ/Pgfplots pouvant être facilement incorporées dans des documents en LaTeX. Il gère la conversion de la plupart des figures d’Octave, y compris les tracés en 2D et 3D.

Ce paquet est aussi compatible avec le logiciel MATLAB (non libre).

MayaVi2 est un outil multiplateformes de visualisation de donnée scientifiques 2D et 3D. Ses fonctionnalités incluent :

• Visualisation de données scalaires, en vecteur et de tenseur en 2 et 3 dimensions
• Scriptabilité simple en Python
• Extensitivé simple via des sources personnalisée, des modules et des filtres de données
• lecture de divers formats de fichiers : VTK (de base et XML), PLOT3D, etc.
• Enregistrement des visualisations
• Enregistrement des visualisations affichées dans divers formats d'image.

MayaVi2 a été conçu pour être scriptable et extensible. Si vous pouvez utiliser l'application mayavi2 elle-même, vous pouvez l'utiliser comme greffon Envisage, ce qui vous permet de l'embarquer nativement dans des applications utilisateur. Vous pouvez aussi l'utiliser comme un moteur de

 visualisation pour une application.

Ce paquet fournit également TVTK, qui englobe des objets VTK pour offrir une API pratique et en Python, tout en supportant les attributs Traits et les palettes NumPy/SciPy. TVTK est en général implémenté en pur Python, sauf pour un petit module complémentaire.

This package is a transitional dummy package and can be safely removed.

Open3D is an open-source library that supports rapid development of software that deals with 3D data. The Open3D frontend exposes a set of carefully selected data structures and algorithms in both C++ and Python. The backend is highly optimized and is set up for parallelization.

This package provides additional tools for data processing.

ParaView est une application multi-plateforme au code source ouvert conçue pour visualiser des ensembles de données allant du plus petit au plus grand. Les buts du projet ParaView incluent les éléments suivants :

 – développer une application de visualisation, multi-plateforme et au code
   source ouvert ;
 – prendre en charge les modèles de calcul distribué pour traiter de grands
   ensembles de données ;
 – créer une interface pour l’utilisateur libre, adaptable et intuitive ;
 – développer une architecture extensible basée sur les normes ouvertes.

ParaView s’exécute aussi bien sur des systèmes distribués avec partage de mémoire que sur des systèmes avec processeur unique, et a été testé avec succès sur Windows, Mac OS X, Linux et sur diverses stations de travail Unix, des grappes et des supercalculateurs. Sous le capot, ParaView utilise la boîte à outils de visualisation « Visualization Toolkit » pour le traitement des données et le moteur de rendu et possède une interface écrite en Qt.

PDL (Perl Data Language — « langage de données Perl ») donne au Perl standard la possibilité de stocker d'une manière COMPACTE et de manipuler RAPIDEMENT des grands tableaux de données à N dimensions qui sont les bases du calcul scientifique. L'idée est de faire de Perl un langage de calcul numérique, libre, orienté sur les tableaux de la même manière que les paquets commerciaux comme IDL et MatLab. Il est possible d'écrire des expressions en Perl simples pour manipuler des tableaux numériques complets en une fois. Par exemple, en utilisant PDL, la variable de Perl $a peut contenir une image 1024x1024 en virgule flottante, en ne prenant que 4 Mo de mémoire et des expressions comme $a=sqrt($a)+2 manipulent l'image en quelques secondes.

Un interpréteur de commandes interactif simple (perldl) est fourni pour une utilisation en ligne de commande ainsi qu'un module (PDL) pour l'utilisation dans les scripts en Perl.

Gnuplot.py est un module Python qui s'interface avec Gnuplot, le programme de tracé de courbes populaire. Il vous permet d'utiliser gnuplot depuis Python sur des tableaux de données situés en mémoire, des fichiers de données ou des fonctions mathématiques. Si vous utilisez Python pour effectuer des calculs ou comme « colle » pour les programmes numériques, vous pouvez utiliser ce module pour dessiner des données au fur et à mesure de leur calcul. Et la combinaison avec Python rend facile l'automatisation des choses, y compris la création « d'animations » brutes en dessinant les différents jeux de données les uns après les autres.

PyQtGraph est une bibliothèque d’interface graphique et de graphisme en Python pur, construite sur PyQt4 et numpy. Elle est conçue pour des applications mathématiques, scientifiques et d’ingénierie. Quoiqu’entièrement écrite en Python, cette bibliothèque est très rapide à cause de son exploitation intense de numpy pour le calcul et du cadriciel GraphicsView de Qt pour un affichage rapide.

Il s'agit de la version Python 3 du paquet.

Seaborn is a library for making attractive and informative statistical graphics in Python. It is built on top of matplotlib and tightly integrated with the PyData stack, including support for numpy and pandas data structures and statistical routines from scipy and statsmodels.

Some of the features that seaborn offers are

• Several built-in themes that improve on the default matplotlib aesthetics
• Tools for choosing color palettes to make beautiful plots that reveal patterns in your data
• Functions for visualizing univariate and bivariate distributions or for comparing them between subsets of data
• Tools that fit and visualize linear regression models for different kinds of independent and dependent variables
• A function to plot statistical timeseries data with flexible estimation and representation of uncertainty around the estimate
• High-level abstractions for structuring grids of plots that let you easily build complex visualizations

This is the Python 3 version of the package.

Pyxplot est un paquet contenant un outil polyvalent de traçage de graphes, un langage de script pour scientifique, une suite pour graphisme vectoriel et un traitement de données. L’interface est conçue pour que les tâches courantes – par exemple, le traçage de graphes étiquetés de données – soient réalisables à l’aide de commandes courtes, simples et intuitives.

Pyxplot produit des figures de qualité professionnelle. À cette fin, les textes sont créés avec toute la beauté et flexibilité de l’environnement de composition LaTex.

Une documentation complète et des exemples sont disponibles dans le paquet pyxplot-doc. Une galerie d’exemples de traçage est disponible sur le site web du projet.

Traceur 2D avec zoom infini, sélection de valeur, tuyau en entrée et affichage de points illimité. Quickplot vise à d'abord examiner vos données rapidement, puis ensuite en tracer des images statiques. C'est un visualiseur de données, pas un éditeur de points. Il lit le texte ASCII et les fichiers sons. Il possède de nombreuses options en ligne de commande, le rendant très facile d'utilisation dans un script shell.

Collection of plotting and table output functions for data visualization. Results of various statistical analyses (that are commonly used in social sciences) can be visualized using this package, including simple and cross tabulated frequencies, histograms, box plots, (generalized) linear models, mixed effects models, principal component analysis and correlation matrices, cluster analyses, scatter plots, stacked scales, effects plots of regression models (including interaction terms) and much more. This package supports labelled data.

SolveSpace est un programme de CAO paramétrique pour la 2D et 3D. Applications incluses :

 – modélisation en 3D : dessin avec des opérations d’extrusion, de
   révolution et booléennes (union, différence ou intersection) ;
 – modélisation en 2D : dessin de pièces en vue simple et exportation en
   DXF, PDF ou SVG, utilisation de l’assemblage en 3D pour vérifier la
   concordance ;
 – impression en 3D : exportation du STL ou autre maillage triangulaire
   attendu par la plupart des imprimantes en 3D ;
 – préparation des données CAM : exportation du dessin vectoriel en 2D pour
   un découpage au jet d’eau ou par laser, ou génération de STEP ou STL
   pour importation dans un logiciel CAM tiers pour usinage ;
 – conception de mécanisme : utilisation du solveur de contraintes pour
   simuler les couplages planaires ou spatiaux avec des tourillons, des
   billes ou des articulations en glissière ;
 – géométrie en deux ou trois dimensions : remplacement de la trigonométrie
   et des feuilles de calcul à la main avec le dessin aux dimensions en
   direct.

trend is a general-purpose, efficient trend graph for "live" data. Data is read in ASCII form from a file or continuously from a FIFO and displayed in real-time into a multi-pass trend (much like a CRT oscilloscope). trend can be used as a rapid analysis tool for progressive or time-based data series together with trivial scripting.

Tulip is an information visualization framework dedicated to the analysis and visualization of relational data. It aims to provide the developer with a complete library, supporting the design of interactive information visualization applications for relational data that can be tailored to the problems he or she is addressing.

It includes the following features:

• 3D visualizations
• 3D modifications
• Plug-in support for easy evolution
• Building of clusters and navigation into them
• Automatic drawing of graphs
• Automatic clustering of graphs
• Automatic selection of elements
• Automatic metric coloration of graphs

A free cross-platform library of fast C++ routines for plotting data in up to 3 dimensions. It can export plots to bitmaps and vector EPS, SVG, IDTF files. There are simple window interfaces based on GLUT, FLTK and/or Qt. MathGL can also be used in the console. There are interfaces to a set of languages, such as, C, Fortran, Pascal, Forth, Python, Octave.

This package contains the udav window environment based on mathgl.

Veusz is a 2D and 3D scientific plotting and graphing package, designed to produce publication-ready PDF, SVG, Postscript and bitmap output. Veusz provides a GUI, command line and scripting interface (based on Python) to its plotting facilities. The plots are built using an object-based system to provide a consistent interface.

This package includes the main executable, documentation and examples.

VisTrails est un système, à source ouvert, de gestion de provenance et de flux de travail scientifique développé à l’université d’Utah, fournissant une prise en charge de l’exploration et de la visualisation de données. Tandis que les flux de travail ont été traditionnellement utilisés pour automatiser les tâches répétitives, pour les applications exploratoires par nature, telles les simulations, l’analyse de données et leur visualisation, il y a peu de répétitions – le changement est la norme. De la manière dont un ingénieur ou un scientifique font et évaluent des hypothèses sur des données d’étude, une série de différents, quoique liés, flux de travail est créée pendant l’ajustement d’un flux lors d’un processus interactif. VisTrails a été conçu pour gérer ces flux évoluant rapidement.

Yorick is an interpreted programming language for:

• scientific simulations or calculations
• postprocessing or steering large simulation codes
• interactive scientific graphics
• reading, writing, and translating large files of numbers

The language features a compact syntax for many common array operations, so it processes large arrays of numbers very quickly and efficiently. Superficially, yorick code resembles C code, but yorick variables are never explicitly declared and have a dynamic scoping similar to many Lisp dialects. The yorick language is designed to be typed interactively at a keyboard, as well as stored in files for later use.

This package includes an emacs-based development environment, which you can launch by typing M-x yorick in emacs.

Many add-on packages and plug-ins are available for Yorick (the package names begin with "yorick-"). You may want to install the yorick-full metapackage which depends on the vast majority of them.

Circos affiche les données dans un graphe circulaire, de manière idéale pour étudier les relations entre objets ou positions et créer des graphiques hautement informatifs et de qualité publiable.

Ce paquet fournit le moteur de dessin de graphiques Circos qui se pilote à la ligne de commande (comme gnuplot) et est entièrement scriptable.

Circos affiche les données dans un graphe circulaire, de manière idéale pour étudier les relations entre objets ou positions et créer des graphiques hautement instructifs et dignes de publication.

Ce paquet fournit un ensemble d’outils permettant de traiter des données : binlinks, bundlelinks, categoryviewer, colorinterpolate, filterlinks, maketutorialimages, orderchr, randomlinks, resample et tableviewer.

Findimagedupes est un utilitaire en ligne de commande réalisant un « diff » visuel grossier entre deux images. Cela permet de comparer deux images ou un arbre complet d’images, et déterminer s’il existe des images identiques ou similaires. Avec des types d’images ordinaires, la précision de findimagedupes serait autour de 98 %.

JEuclid is a complete MathML rendering solution, consisting of:

• A MathViewer application
• Command line converters from MathML to other formats
• An ant task for automated conversion
• Display components for AWT and Swing
• A component for Apache Cocoon

This package contains the Swing MathViewer application.

Coin is an OpenGL-based, retain-mode 3D graphics library that implements the Open Inventor 2.1 API. It also includes support for VRML97 and 3D audio.

GtkMathView is a C++ rendering engine for MathML documents. It provides an interactive view that can be used for browsing and editing MathML markup.

GtkMathView reads MathML documents by means of a frontend whose purpose is to traverse the MathML document (or part of it) and to appropriately instantiate GtkMathView's internal data structures that are suitable for rendering it. Currently the following frontends are supported: libxml2 (tree view using libxml2 API), libxml2 reader (event view using libxml2 reader API), GMetaDOM (tree view using DOM API), custom (application-specific view with application-provided callbacks).

GtkMathView renders MathML documents through a backend whose purpose is to provide an interface between the portable rendering engine and the platform-specific capabilities (like retrieving fonts, drawing on the screen, and so on). Currently the following backends are provided: GTK+, GTK+ widget, PostScript, SVG, AbiWord.

This package includes utilities to view and render MathML documents.

La bibliothèque GTS est prévue pour fournir un ensemble de fonctions utiles pour traiter des surfaces en 3D maillées avec des triangles interconnectés.

Ce paquet fournit des binaires d’utilitaires.

La bibliothèque Puzzle est conçue pour trouver rapidement des images visuellement similaires (GIF, PNG, JPG), même si elles ont été redimensionnées, recompressées, recolorisées ou modifiées légèrement.

Ce paquet fournit l’outil en ligne de commande : puzzle-diff.

SoQt is a Qt GUI component toolkit library for Coin, based on the API of the InventorXt GUI component toolkit. SoQt is also compatible with OpenInventor of SGI and TGS.

SoQt provides a class-hierarchy of viewer classes that ranges from a simple render canvas (the SoQtRenderArea), providing only the basic synchronization and device input conversion routines between Qt and Coin, up to 3 different full-featured viewer classes (SoQtExaminerViewer, SoQtPlaneViewer and SoQtFlyViewer) with input device handling logic and user interfaces to let the application programmer do Rapid Application Development.

This library is linked against Qt version 5.

The Visualization Toolkit (VTK) is an open-source software system for 3D computer graphics, image processing, and visualization.

This package provides the VTK header files required to compile C++ programs that use VTK to do 3D visualisation.

The Visualization Toolkit (VTK) is an open-source software system for 3D computer graphics, image processing, and visualization.

This package provides the VTK header files required to compile C++ programs that use VTK to do 3D visualisation. Qt files

Ce métapaquet installera les paquets Debian qui peuvent être utiles dans le cadre du traitement et de la visualisation d'images médicales.

D’une part, il installe plusieurs paquets prenant en charge divers formats de fichier d’image, comme DICOM (« Digital Imaging and Communications in Medecine ») qui est le standard de facto pour la gestion d'images médicales, ou NIFTI. D’autre part, il fournit divers paquets logiciels pouvant être utilisés pour la visualisation et le traitement d’images, soit à partir d’une interface graphique, de la ligne de commande ou implantées dans un flux de travail.

Matplotlib est une bibliothèque de traçage en Python pur conçue pour apporter à Python des capacités de traçage d'une qualité adaptée à la publication, avec une syntaxe familière aux utilisateurs de Matlab. L'accès à toutes les commandes de traçage, dans l'interface pylab, est possible soit à travers une interface fonctionnelle familière aux utilisateurs de Matlab, soit à travers une interface orientée objet familière à ceux de Python.

The Visualization Toolkit (VTK) is an open-source software system for 3D computer graphics, image processing, and visualization.

This package provides the python3 bindings for VTK.

This GNU R package provided a set of functions for drawing some special plots:

• stem.leaf plots a stem and leaf plot,
• stem.leaf.backback plots back-to-back versions of stem and leafs,
• bagplot plots a bagplot,
• skyline.hist plots several histgramm in one plot of a one dimensional data set,
• plotsummary plots a graphical summary of a data set with one or more variables,
• plothulls plots sequentially hulls of a bivariate data set,
• faces plots chernoff faces,
• spin3R for an inspection of a 3-dim point cloud,
• slider functions for interactive graphics.

Carries out mapping between assorted color spaces including RGB, HSV, HLS, CIEXYZ, CIELUV, HCL (polar CIELUV), CIELAB and polar CIELAB. Qualitative, sequential, and diverging color palettes based on HCL colors are provided.

ggplot2 combines the advantages of both base and lattice graphics. Conditioning and shared axes are handled automatically, and you can still build up a plot step by step from multiple data sources. It also implements a sophisticated multidimensional conditioning system and a consistent interface to map data to aesthetic attributes.

This system extends Wilkinsons optimization-based labeling approach to create a more robust, full-featured axis labeler.

Ce paquet R fournit de nombreux tracés, ainsi que diverses étiquettes, axes et fonctions d'échelle de couleur.

arctext : affiche un texte sur un arc circulaire ; barhier : affiche un jeu de variables associées hiérarchiquement ; barp : une routine de traçage en barre ; bin.wind.records : classe les enregistrements de direction et de vitesse de vent ; centipede.plot : affiche un traçé de millième ; clock24.plot : valeurs de point sur une horloge (« clockface ») de 24 heures ; color.legend : légende qui fait correspondre des catégories ou valeurs à des couleurs.; dotplot.mtb : traçé point par point dans le style de Minitab ; gantt.chart : affiche un diagramme de Gantt ; intersectDiagram : affiche des séries d'intersections ; multhist : traçe un histogramme multiple dans un diagramme en barre ; polar.plot : traçe des valeurs sur une grille circulaire de 0 à 360 degrés ; vectorField : affiche les vecteurs de magnitude ou direction ; weighted.hist : affiche un histogramme pondéré.

et bien d'autre encore. Pour en savoir plus, veuillez consulter la page http://cran.r-project.org/web/packages/plotrix/plotrix.pdf

qqman is an add-on package for the R statistical environment. This package provides functions for visualizing Genome-Wide Association Studies (GWAS) results using Manhattan plots and Quantile-Quantile plots.

Graphical scales map data to aesthetics, and provide methods for automatically determining breaks and labels for axes and legends.

Scatterplot3d est un paquet de GNU R pour la visualisation de données à plusieurs variables dans un espace tridimensionnel. À la base, scatterplot3d génère un tracé de nuage de points dans l’espace en 3D en utilisant une projection parallèle. De plus hautes dimensions (quatre, cinq, etc.) peuvent être affichées dans une certaine mesure en utilisant des couleurs, des types de symbole ou des tailles de symboles différents.

This GNU R package provides functions for plotting graphical shapes such as ellipses, circles, cylinders, arrows, ...

Violin plots are a method of plotting numeric data. A violin plot is a combination of a box plot and a kernel density plot. Specifically, it starts with a box plot. It then adds a rotated kernel density plot to each side of the box plot.

The Visualization Toolkit (VTK) is an open-source software system for 3D computer graphics, image processing, and visualization.

This package provides examples for VTK9

Many routines are included in pgplot for viewing scientific data. Many (about 70) output devices are supported. 2-D, 3-D, contour, image manipulation, etc. are well supported. Interactive routines are included. Both a C and a FORTRAN library are present.

OVITO is a scientific data visualization and analysis software for atomistic, molecular and other particle-based simulations.

The Apache Cassandra database is the right choice when you need scalability and high availability without compromising performance. Linear scalability and proven fault-tolerance on commodity hardware or cloud infrastructure make it the perfect platform for mission-critical data. Cassandra's support for replicating across multiple datacenters is best-in-class, providing lower latency for your users and the peace of mind of knowing that you can survive regional outages.

Grits is a "Virtual Globe" library which uses OpenGL to render an image of the earth using satellite and terrain data from publicly accessible servers. This is similar in concept to Google Earth and NASA World Wind, except implemented as a library.

This package contains the header files and libraries which are needed for developing programs that use grits.

PlotDrop is designed for quick simple visualisation of 2D data series. It is intended to be used in tandem with an external filesystem browser such as GNOME's nautilus or KDE's konqueror. Files containing data are added by dragging them from the browser to the file list.

Qtiplot is a fully fledged plotting software similar to the OriginLab Origin software (See http://www.originlab.com for more information about Origin).

It can make two and three dimensional plots of publication quality, both from datasets and functions. It can do non-linear fitting and multi-peak fitting.

Some Features:

• Cross platform: works natively on Windows, Mac OS X and Linux/Unix systems
• Fully Python scriptable
• OpenGL based 3D plotting
• Publication quality plots and easy export to various image formats (EMF, EPS, PS, PDF, SVG, BMP, JPG, PNG, TIFF, etc ...)
• Easy integration with LaTeX typesetting system
• Powerful and versatile spreadsheets with column-logic calculations and easy import/export of multiple files
• One-click access to extensive built-in data analysis routines
• Advanced statistical analysis: Student's t-Test, ANOVA, chi-square test for variance, normality test (Shapiro-Wilk)
• Linear and nonlinear curve fitting with weighting and estimation of statistical errors of the fit-parameters
• Multi-peak fitting
• Image analysis tools
• Templates support: all settings for plots, tables and matrices can be saved and restored later on for a fast editing process
• Project files based on folders, a powerful project explorer with built-in drag and drop and searching facilities
• Full import of Excel workbooks and Open Document Format spreadsheets, dBase, SQLite and Microsoft Access databases

RLPlot is a GUI based program for displaying scientific data in standard formats. It has full support for all error-bar types and it has greater flexibility with displaying colour and texture in charts than gnuplot (filled bar chart boxes are possible without any additional programs). Output is generated on the X display where further changes can be made to the graph using point and click methods. Images can be exported as scalable vector graphics (SVG) as well as EPS, WMF and TIFF formats.

VisIt is a free interactive parallel visualization and graphical analysis tool for viewing scientific data. Users can quickly generate visualizations from their data, animate them through time, manipulate them, and save the resulting images for presentations. VisIt contains a rich set of visualization features so that you can view your data in a variety of ways. It can be used to visualize scalar and vector fields defined on two- and three-dimensional (2D and 3D) structured and unstructured meshes.

VisIt was designed to handle very large data set sizes in the terascale range and yet can also handle small data sets in the kilobyte range.

This package provides tools to generate plots and labeled axes easily. It draws normal plots, logplots and semi-logplots. Axis ticks, labels, legends (in case of multiple plots) can be added with key-value options. It can cycle through a set of predefined line/marker/color specifications. In summary, its purpose is to simplify the generation of high-quality function plots, especially for use in scientific contexts (logplots).