Debian Science Meteorology packages

CDFTOOLS is a diagnostic package written in fortran 90 for the analysis of NEMO model output in the frame of the DRAKKAR project. NEMO (Nucleus for European Modelling of the Ocean) is a state-of-the-art modeling framework for oceanographic research, operational oceanography seasonal forecast and climate studies.

Climate Data Operators sind eine Sammlung von Befehlszeilen-Operatoren, um Klimamodelldaten zu manipulieren und zu analysieren. Unterstützte Datenformate sind Grib, netCDF, SERVICE, EXTRA und IEG. Es stehen mehr als 400 Operatoren zur Verfügung.

This package contains tables for use with CMOR that describe the variables and format of data needed.

CMOR software uses these tables to verify that output is valid.

The Common Data Access framework allows reading of scientific data to manipulate and analyse Climate model Data. Supported data formats are GRIB, netCDF, SERVICE, EXTRA and IEG. There are more than 400 operators available.

Cylc ("silk") is a suite engine and meta-scheduler that specializes in suites of cycling tasks for weather forecasting, climate modeling, and related processing (it can also be used for one-off workflows of non-cycling tasks, which is a simpler problem).

Ferret is an interactive computer visualization and analysis environment designed to meet the needs of oceanographers and meteorologists analyzing large and complex gridded data sets. It can transparently access extensive remote Internet data bases using OPeNDAP (formerly known as DODS)

Ferret has a Mathematica-like flexibility, geophysical formatting, "intelligent" connection to its data base, memory management for very large calculations, and symmetrical processing in 4 dimensions. It can work on both gridded and non-gridded datasets.

The FLEXPART model is a Lagrangian Particle Dispersion Model developed at the Norwegian Institute for Air Research in the Department of Atmospheric and Climate Research. The model development team consists of Andreas Stohl (who originally wrote FLEXPART), Sabine Eckhardt, Harald Sodemann, and John Burkhart.

Trajectory models are important tools for studying transport phenomena in the atmosphere. In the environmental sciences, they are often used to establish source-receptor relationships of air pollutants.

FLEXTRA can be used to calculate different types of forward or backward trajectories, and has facilities to estimate the uncertainty of trajectories. It is specifically designed to compute long time sequences of trajectories for many receptor locations.

FLEXTRA may be used with the Metview meteorological workstation to visualize trajectories.

fpzip is a library and command-line utility for lossless and optionally lossy compression of 2D and 3D floating-point arrays. fpzip assumes spatially correlated scalar-valued data, such as regularly sampled continuous functions, and is not suitable for compressing unstructured streams of floating-point numbers. This package provides command-line utilities.

Das Grid Analysis and Display System (GrADS, System für Netzanalyse und Anzeige) ist ein interaktives Werkzeug für den Desktop. Es wird für den einfachen Zugriff auf, Manipulation und Visualisierung von geowissenschaftlichen Daten eingesetzt. Das Programm kann Daten in den Formaten binär, GRIB, NetCDF oder HDF-SDS (Scientific Data Sets) bearbeiten. GrADS wurde weltweit für eine Vielzahl gängiger Betriebssysteme realisiert und wird frei über das Internet vertrieben.

GrADS arbeitet mit 4-dimensionalen Daten: Länge, Breite, vertikale Ebene (Höhe) und Zeit. Datensätze werden mittels einer Datenbeschreibungsdatei im 4-D-Raum positioniert. GrADS wertet Stationsdaten sowie gerasterte Daten aus. Die Netze können regelmäßige, nichtlineare, normalverteilte und variable Abstände haben. Daten aus verschiedenen Datensätzen können mit der richtigen räumlichen und zeitlichen Darstellung grafisch überlagert werden. Operationen werden interaktiv durch Eingabe FORTRAN-ähnlicher Ausdrücke auf der Kommandozeile initiiert. Ein reicher Satz von eingebauten Funktionen ist vorhanden, die Benutzer können aber auch ihre eigenen Funktionen als externe Routinen in einer beliebigen Programmiersprache schreiben.

Die Daten können mit einer Vielzahl von grafischen Techniken angezeigt werden: Linien-, Balken- und Streudiagramme, geglättete und schattierte Konturen, Stromlinien, Wind-Vektoren, einfache oder schattierte »grid boxes« sowie grafische Darstellungen von Stationsmodellen. Grafiken können in PostScript oder verschiedenen Bildformaten ausgegeben werden. GrADS bietet intuitive geophysikalische Voreinstellungen. Der Benutzer kann aber optional alle Aspekte der Grafikausgabe kontrollieren.

GrADS verfügt über eine programmierbare Schnittstelle (Skriptsprache), die anspruchsvolle Analyse- und Anzeigeprogramme ermöglicht. Verwenden Sie Skripte, die Schaltflächen, aufklappende Menüs sowie Grafiken anzeigen und dann entsprechend auf das »point-and-click« des Anwenders reagieren. GrADS kann im Batch-Modus ausgeführt werden. Die Skriptsprache erleichtert es, mit GrADS über Nacht umfangreiche Berechnungen (Batch-Jobs) auszuführen.

HARP is a toolset for ingesting, processing and inter-comparing satellite or model data against correlative data. The toolset is composed of a set of command line tools, a C library of analysis functions, and import/export interfaces for Python. The main goal of HARP is to assist in the inter-comparison of data sets. By appropriatelty chaining calls to the HARP command line tools one can preprocess satellite, model, and/or correlative data such that two datasets that need to be compared end up having the same temporal/spatial grid, same data format/structure, and same physical units.

This package provides the HARP binary utilities.

Atlas is an ECMWF library for parallel data-structures supporting unstructured grids and function spaces, with the aim to investigate alternative more scalable dynamical core options for Earth System models, and to support modern interpolation and product generation software.

Atlas is predominantly C++ code, with main features available to Fortran codes through a F2003 interface. ECMWF is the European Centre for Medium-Range Weather Forecasts.

OPeNDAP provides software that allows you to access data over the internet, from programs that weren't originally designed for that purpose, as well as some that were. While OPeNDAP is the original developer of the Data Access protocol which its software uses, many other groups have adopted DAP and provide compatible clients, servers and software development kits.

This package contains the 'getdap' client binary.

OPeNDAP provides software that allows you to access data over the internet, from programs that weren't originally designed for that purpose, as well as some that were. While OPeNDAP is the original developer of the Data Access protocol which its software uses, many other groups have adopted DAP and provide compatible clients, servers and software development kits.

ecCodes is the ECMWF encoding/decoding software for GRIB and BUFR.

This is a useful set of command line tools to give quick access to grib messages.

ECMWF is the European Centre for Medium-Range Weather Forecasts.

ecKit is a cross-platform c++ toolkit that supports development of tools and applications at ECMWF. It is based on code developed over the last 20 years within the MARS software and was re-factored out to be reused by other applications. The main focus is UNIX/POSIX systems, and it has been thoroughly tested on AIX, Linux and Mac OSX. Historically, the code base pre-dates and in some way can be seen as a leaner substitute for some 'Boost' libraries.

ECMWF is the European Centre for Medium-Range Weather Forecasts.

The Interpolation library (EMOSLIB) includes Interpolation software and GRIB, BUFR, CREX encoding/decoding routines. It is used by the ECMWF meteorological archival and retrieval system (MARS) and also by the ECMWF graphics package MetView.

This package provide bufr-* and other tools

This is a toolkit from ECMWF to make ecKit interoperable with Fortran.

ECMWF is the European Centre for Medium-Range Weather Forecasts.

MetKit is a toolkit from ECMWF for manipulating and describing meteorological objects, implementing the MARS language and associated processing and semantics.

This package contains the tool 'parse-mars-request'

Magics++ is the latest generation of the ECMWF's Meteorological plotting software MAGICS. Although completely redesigned in C++, it is intended to be as backwards-compatible as possible with the Fortran interface. Besides its programming interfaces (Fortran and C), Magics++ offers MagML, a plot description language based on XML aimed at automatic web production.

This package contains the MagcML binary that may be used with magics++.

Metview has been designed as a flexible, modular and extendible system able to accommodate the evolving needs of the user. The system is based on the ECMWF standards for graphics (Magics) and data access (MARS) but can also access locally stored data. The user interface is based on Motif and Qt. Metview is a fully distributed system where modules can run on different workstations and servers.

Metview is a cooperative project between ECMWF and INPE/CPTEC, Brazil. ECMWF has also been assisted by a staff member of Météo-France.

The NCAR Command Language (NCL) is a free interpreted language designed specifically for scientific data processing and visualization. NCL has robust file input and output. It can read and write netCDF-3, netCDF-4 classic HDF4, HDF5, binary, and ASCII data, and read HDF-EOS2, GRIB1 and GRIB2. The graphics are world class and highly customizable.

The software comes with a couple of useful command line tools: * ncl_filedump - prints the contents of supported files (netCDF, HDF,

  GRIB1, GRIB2, HDF-EOS2, and CCM History Tape)
* ncl_convert2nc - converts one or more GRIB1, GRIB2, HDF and/or HDF-EOS
  iles to netCDF formatted files.

NCO ist eine Zusammenstellung von Programmen, die als Operatoren bekannt sind. Die Operatoren sind eigenständige Kommandozeilenprogramme, die in einer POSIX-Shell ausgeführt werden können. Die Operatoren holen ihre Eingaben aus einer oder mehreren netCDF-Dateien, führen Aufgaben aus (z.B. Durchschnittsberechnung oder Hyperslabbing) und erzeugen eine netCDF-Ausgabedatei. NCO wurde ursprünglich entwickelt, um Klimadaten zu verarbeiten und zu analysieren. Dennoch funktioniert es mit beliebigen Datenbeständen im netCDF-Format.

Sie können ncview verwenden, um schnell und einfach per Knopfdruck Dateien im NetCDF-Format zu betrachten. Sie können einfache Filme der Daten betrachten, Daten in unterschiedlichen Dimensionen darstellen, die tatsächlichen Werte der Daten prüfen, Farbwerte ändern, die Daten invertieren sowie weitere einfache grafische Operationen durchführen.

ODC ist eine Software, die am ECMWF (Europäisches Zentrum für mittelfristige Wettervorhersage) zur Codierung und Verarbeitung von Beobachtungsdaten entwickelt wurde. Sie enthält eine SQL-Filter- und Statistik-Engine, Befehlszeilenwerkzeuge und APIs für C/C ++ und Fortran.

Dieses Paket bietet Werkzeuge für die ODB-Handhabung.

Climate Data Operators are a collection of command line Operators to manipulate and analyse Climate model Data. Supported data formats are GRIB, netCDF, SERVICE, EXTRA and IEG. There are more than 400 operators available. This package provides a Python3 wrapper for CDO.

This module provides a Python3 interface to map GRIB files to the NetCDF Common Data Model following the CF Conventions. The high level API is designed to support a GRIB backend for xarray and it is inspired by NetCDF-python and h5netcdf. Low level access and decoding is performed via the ECMWF ecCodes library.

This is a Python3 interface to CMOR, the Climate Model Output Rewriter.

CMIP5 is the Climate Model Intercomparison Project5. This library supports the generation of paths and filenames corresponding to version 0.28 of thei CMIP Data Reference Syntax. It includes tools for converting from previous CMIP3 forms.

ecCodes is the ECMWF encoding/decoding software for GRIB and BUFR. This is a Python wrapper for the eCCodes library.

ECMWF is the European Centre for Medium-Range Weather Forecasts.

Ferret is an interactive computer visualization and analysis environment designed to meet the needs of oceanographers and meteorologists analyzing large and complex gridded data sets. It can transparently access extensive remote Internet data bases using OPeNDAP (formerly known as DODS)

This is the Python3 wrapper for Ferret

Python 3 module for reading and writing GRIB (editions 1 and 2) files. GRIB is the World Meterological Organization standard for distributing gridded data. The module is a Python 3 interface to the GRIB API C library from the European Centre for Medium-Range Weather Forecasts (ECMWF).

This package also contains the cnvgrib1to2, grib_list, grib_repack, and cnvgrib2to1 scripts.

This package implements the TEOS-10 Equation of State for seawater. TEOS-10 is based on a Gibbs function formulation from which all thermodynamic properties of seawater (density, enthalpy, entropy sound speed, etc.) can be derived in a thermodynamically consistent manner. TEOS-10 was adopted by the Intergovernmental Oceanographic Commission at its 25th Assembly in June 2009 to replace EOS-80 as the official description of seawater and ice properties in marine science.

For further information, see http://www.teos-10.org/

This is a Python3 class to model a state for liquid water or steam with the Industrial Formulation IAPWS-IF97.

Further information on the standard is available at http://www.iapws.org

Magics++ is the latest generation of the ECMWF's Meteorological plotting software MAGICS. Although completely redesigned in C++, it is intended to be as backwards-compatible as possible with the Fortran interface.

This package provides Python3 support for the magics++ library.

Metaconfig is a library for centralising Python's ConfigParser files. It is inspired by the logging module where it is increadibly easy to start writing code that depends on logging whilst deferring how log messages will be handled until later.

NetCDF version 4 has many features not found in earlier versions of the library and is implemented on top of HDF5. This module can read and write files in both the new netCDF 4 and the old netCDF 3 format, and can create files that are readable by HDF5 clients. The API is modelled after Scientific.IO.NetCDF, and should be familiar to users of that module.

Most new features of netCDF 4 are implemented, such as multiple unlimited dimensions, groups and zlib data compression. All the new numeric data types (such as 64 bit and unsigned integer types) are implemented. Compound and variable length (vlen) data types are supported, but the enum and opaque data types are not. Mixtures of compound and vlen data types (compound types containing vlens, and vlens containing compound types) are not supported.

This package contains the netCDF 4 module for Python 3.

This is a python3 interface to spherepack, a library for geophysical processes.

Diese Anwendung wurde mit dem Qt-Toolkit geschrieben und ermöglicht:

• Visualisierung von meteorologischen Daten aus Dateien im GRIB Format 1
• automatischer Download von GRIB-Daten
• automatischer Download von IAC-Daten (Fleet Code)

Gerris ist ein System für die Lösung partieller Differentialgleichungen, die strömende Flüssigkeiten beschreiben.

Eine kurze Zusammenfassung der (derzeit) wichtigsten Möglichkeiten:

• Löst die zeitabhängigen, nicht komprimierbaren Euler-, Stokes- oder Navier-Stokes-Gleichungen mit variabler Dichte
• Adaptive Gitterverfeinerung: die Auflösung wird dynamisch der Strömung angepasst
• Komplett automatische Erstellung von Gittern in komplexer Geometrie
• Zweiter Ordnung in Raum und Zeit
• Unbeschränkte Anzahl von advektierten/diffundierten passiven Markern
• Flexible Spezifikation von zusätzlichen Quelltermen
• Portable Unterstützung für parallele Berechnungen durch die MPI-Bibliothek
• Mehrphasenströmungs-Methode (Volume-of-Fluid) für Strömungen zwischen zwei Flächen

Dieses Paket besitzt eingebaute MPI-Unterstützung.

GNU Data Language (GDL) is a free IDL (Interactive Data Language) compatible incremental compiler. It has full syntax compatibility with IDL 7.1. IDL is a registered trademark of ITT Visual Information Solutions. From IDL 8.0, the following language elements are supported:

• FOREACH loop
• negative array indices
• garbage collection pointers and objects
• call methods on an object using "." (e. g. object.aMemberProcedure,arg1)

The file input output system is fully implemented. GUI support (widgets) is officially provided, but it's not complete yet.

This package contains the main commandline and interpreter frontend.

ParaView ist eine quelloffene, Multi-Plattform-Anwendung, konzipiert um Datensätze unterschiedlichster Größe zu visualisieren. Die Ziele des ParaView-Projekts:

* Entwickle eine quelloffene, Multi-Plattform-Visualisierungsanwendung.
* Unterstütze verteilt berechnete Modelle, um große Datensätze zu
  verarbeiten.
* Erstelle eine offene, flexible und intuitive Benutzerschnittstelle.
* Entwickele eine erweiterbare Architektur, basierend auf offenen
  Standards.

ParaView läuft auf verteiltem (distributed) und geteiltem (shared) Speicher parallel ebenso wie auf Einzelprozessorsystemen und wurde erfolgreich unter Windows, MacOS X, Linux und verschiedenen Unix-Arbeitsstationen, Rechner-Clustern und Supercomputern getestet. Unter der Haube gesehen verwendet ParaView das Visualization Toolkit als Datenverarbeitungs- und Render-Maschine, und hat eine in Qt programmierte Benutzerschnittstelle.

OpenTURNS is a powerful and generic tool to treat and quantify uncertainties in numerical simulations in design, optimization and control. It allows both sensitivity and reliability analysis studies:

• defining the outputs of interest and decision criterion;
• quantify and model the source of uncertainties;
• propagate uncertainties and/or analyse sensitivity and
• rank the sources of uncertainty

Targeted users are all engineers who want to introduce the probabilistic dimension in their so far deterministic studies.

This package provides the Python3 bindings to the library.

R ist ein System für statistische Berechnungen und Grafiken. Es besteht aus einer Sprache mit grafischer Laufzeitumgebung und einem Debugger. Der Zugriff auf bestimmte Systemfunktionen und die Ausführung von Skriptdateien ist möglich.

Der Entwurf von R wurde stark von zwei existierenden Sprachen beeinflusst: S von Becker, Chambers & Wilks und Scheme von Sussman. Während die resultierende Sprache ein S ähnelndes Aussehen hat, stammt die Semantik und die interne Implementierung von Scheme ab.

Der Kern von R ist eine interpretierte Programmiersprache, die Verzweigungen und Schleifen sowie modulare Programmierung unter Verwendung von Funktionen ermöglicht. Die meisten dem Anwender zugänglichen Funktionen von R sind in R geschrieben. Der Anwender kann zur Effizienzsteigerung in den Sprachen C, C++ oder Fortran geschriebene Funktionen einsetzen, was auch viele Grundfunktionen von R ausnutzen. Die R-Distribution enthält Funktionalitäten für eine große Zahl statistischer Verfahren und die zugrunde liegenden mathematischen Berechnungen. Es gibt auch eine Vielzahl von Funktionen, die zusammen eine flexible grafische Umgebung für die Erzeugung vielfältiger grafischer Darstellungen bilden.

Zusätzlich sind mehrere tausend Erweiterungs-»Pakete« beim Comprehensive R Archive Network (CRAN) verfügbar. Viele von ihnen sind auch als Debian-Pakete verfügbar, deren Namen dem Schema »r-cran-« folgen.

Dieses Metapaket vereinfacht den Übergang von dem Paket-Setup vor 1.5.0 mit seinem größeren »r-base«-Paket. Einmal installiert, kann es gefahrlos entfernt werden und apt-get wird automatisch seine Komponenten bei zukünftigen Upgrades aktualisieren. Die Bereitstellung dieses Pakets ermöglicht Anwendern, nur r-base-core zu installieren, wenn sie dies wünschen.

MBDyn is the first free general purpose Multibody Dynamics analysis software.

MBDyn features the integrated multidisciplinary simulation of multibody, multiphysics systems, including nonlinear mechanics of rigid and flexible bodies (geometrically exact & composite-ready beam and shell finite elements, component mode synthesis elements, lumped elements) subjected to kinematic constraints, along with smart materials, electric networks, active control, hydraulic networks, and essential fixed-wing and rotorcraft aerodynamics.

MBDyn simulates the behavior of heterogeneous mechanical, aeroservoelastic systems based on first principles equations.

MBDyn can be easily coupled to external solvers for co-simulation of multiphysics problems, e.g. Computational Fluid Dynamics, terradynamics, block-diagram solvers like Scicos, Scicoslab and Simulink, using C, C++ or Python peer-side API.

MBDyn is being actively developed and used in the aerospace (aircraft, helicopters, tiltrotors, spacecraft), wind energy (wind turbines), automotive (cars, trucks) and mechatronic fields (industrial robots, parallel robots, micro aerial vehicles) for the analysis and simulation of the dynamics of complex systems.

Network opensource is a standards based, Free and Open Source catalog application to manage spatially referenced resources through the web. It provides powerful metadata editing and search functions as well as an embedded interactive web map viewer. This website contains information related to the use of the software.