Summary
Molecular Ab Initio Calculations
DebiChem - molekylære Ab Initio-beregninger
Denne metapakke vil installere pakker der udfører molekylære ab
initio-beregninger, som kan være nyttige for kemikere.
Description
For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:
If you discover a project which looks like a good candidate for DebiChem
to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to
send a description of that project to the DebiChem mailing list
Links to other tasks
|
DebiChem Molecular Ab Initio Calculations packages
Official Debian packages with high relevance
aces3
Avancerede koncepter i Electronic Structure III
|
Versions of package aces3 |
Release | Version | Architectures |
jessie | 3.0.8-4 | amd64,armel,armhf,i386 |
bookworm | 3.0.8-9 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bullseye | 3.0.8-7 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 3.0.8-6 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 3.0.8-5.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
Debtags of package aces3: |
role | program |
|
License: DFSG free
|
ACESIII er et program for elektronisk stukturberegning med fokus på
korrelaterede metoder. Det er den parallelle efterfølger til ACESII, der
indarbejder Super Instruction Assembly Language (SIAL) som
paralleliseringsrammeværktøj.
Inkluderede funktioner:
Energier, analytiske gradienter og analytiske hessematricer for de
følgende metoder:
- Begrænset/ubegrænset spin eller begrænset open-shell Hartree-Fock (HF)
- Andenrangs Moeller-Plesset perbutationsteori (MP2)
Energier og analytiske gradienter for de følgende metoder:
- Coupled cluster singles and doubles (CCSD)
Derudover kan programmet beregne de følgende metoder:
- Coupled cluster singles and doubles with pertubative triples (CCSD(T))
- Quadratic configuration-interaction singles and doubles (QCISD)
Forhøjede tilstande kan beregnes med de følgende metoder:
- Qadratic configuration interaction singles and doubles
- Coupled cluster equation-of-motion (EOM-CC)
Programmet inkluderer også et internt optimeringsprogram for
koordinatgeometri. Hvis analytiske gradienter ikke er tilgængelige, så
bruges numeriske gradienter via finitte forskelle.
Please register by following this link if you are using aces3.
|
|
bagel
|
Versions of package bagel |
Release | Version | Architectures |
buster | 1.2.2-1 | amd64,arm64 |
bullseye | 1.2.2-2 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
stretch | 0.0~git20170109-1 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
bookworm | 1.2.2-6 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
trixie | 1.2.2-8 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
sid | 1.2.2-8 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
|
License: DFSG free
|
BAGEL (Brilliantly Advanced General Electronic-structure Library) er en
beregningskemipakke rettet mod parallelle beregninger i stor skala. Pakken
specialiserer sig i meget præcise metoder og inkluderer tæthedstilpasning
og relativistiske effekter for de fleste af metoderne den implementerer.
Pakken kan beregne energier og overgange for de følgende metoder:
- Hartree-Fock (HF)
- Density-Functional Theory (DFT)
- Second-order Moeller-Plesset perturbation theory (MP2)
- Complete active space SCF (CASSCF)
- Complete active space second order perturbation theory (CASPT2)
- Extended multistate CASPT2 (XMS-CASPT2)
Derudover kan der beregnes energier for de følgende metoder:
- Configuration-interaction singles (CIS)
- Full configuration-interaction (FCI)
- Multi-state internally contracted multireference configuration-
interaction (ic-MRCI)
- N-electron valence-state second order perturbation theory (NEVPT2)
- Active-space decomposition (ASD) for dimere og for flere sider via
density matrix renormalization group (ASD-DMRG)
BAGEL kan optimere stationære geometrier og koniske kryds og beregne
vibrationsfrekvenser.
BAGEL inkluderer ikke en diskgrænseflade, så beregninger skal passe ind i
hukommelsen.
|
|
chemps2
Kørbar fil til at kalde libchemps2-3t64 fra kommandolinjen
|
Versions of package chemps2 |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 1.8.10-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 1.8.12-3.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
stretch | 1.8.3-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.8.9-1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bookworm | 1.8.12-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
|
License: DFSG free
|
Chemps2 er et videnskabeligt bibliotek, som indeholder en spin-tilpasset
implementering af »density matrix renormalization group« (DMRG) for ab
initio-kvantumkemi. Denne metode giver mulighed for at opnå numerisk
præcision i aktive rum udover funktionaliteten for »full configuration
interaction« (FCI) og tillader udtrækning af 2-, 3- og 4-partikel
reducerede tæthedsmatricer (2-, 3-, og 4-RDM) for det aktive rum.
For generelle aktive rum kan op til 40 elektroner i 40 baner håndteres med
DRMG og for en-dimensional aktive rum op til 100 elektroner i 100 baner.
2-RDM'en for disse aktive rum kan også nemt udtrækkes, mens 3- og 4-RDM er
begrænsede til omkring 28 baner.
Når den aktive rumstørrelse bliver uoverkommeligt dyr for FCI, kan DMRG
bruges til at erstatte FCI-løseren i metoden »complete active
space self consistent field« (CASSCF) og den tilsvarende »complete active
space second order perturbation theory« (CASPT2). De tilsvarende metoder
kaldes DMRG-SCF og DMRG-CASPT2, respektiv. For DMRG-SCF er det aktive rum
2-RDM krævet og for DMRG-CASPT2 det aktive rum 4-RDM.
Denne pakke installerer den kørbare fil, som fortolker hamiltonianere i
fcidump-format, udfører DMRG-SCF- og DMRG-CASTP-beregninger som angivet af
brugeren.
|
|
cp2k
Ab initio-molekylærdynamik
|
Versions of package cp2k |
Release | Version | Architectures |
sid | 2023.2-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x |
jessie | 2.5.1-3 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 4.1-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 6.1-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 8.1-9 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bookworm | 2023.1-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
upstream | 2024.3 |
|
License: DFSG free
|
CP2K er et program til at udføre simuleringer af faststof-, fluid-,
molekyl- samt biologiske systemer. Det er specielt rettet mod massivt
parallelle og lineært skalerende elektronstrukturmetoder og simulationer
med moderne ab-initio-molekylærdynamik (AIMD).
CP2K er optimeret til den blandede Gaussfunktions- og planbølgemetode (GPW)
baseret på pseudopotentialer, men er også stand til at køre fuldelektron-
eller rene planbølge-/Gaussfunktionsberegninger. Inkluderede funktioner:
Ab-initio elektronstrukturmetoder med QUICKSTEP-modulet:
- Energier og kræfter fra tæthedsfunktionalteori (DFT)
- Energier og kræfter fra Hartree-Fock (HF)
- Energier og kræfter fra andenordens perturbationsteori med
Møller-Plesset (MP2)
- Energier med random phase approximation (RPA)
- Periodiske eller uperiodiske (gasfase) grænsebetingelser
- Basissæt omfatter flere standardtyper af Gaussorbitaler (GTO'er),
pseudopotentialer med planbølger, »augmented« planbølger (APW) og en
blandet Gaussmetode plus (»augmented«) planbølgemetode (GPW / GAPW)
- Normkonserverende, separable Goedecker-Teter-Hutter-pseudopotentialer
(GTJH) og pseudopotentialer med ikke-lineære kernekorrektioner (NLCC),
eller fuldelektronberegninger
- Lokaltæthedsapproksimationen (LDA) for XC inklusive SVWN3, SVWN5,
PW92 og PADE
- Gradientkorrigerede (GGA) XC-funktionaler inklusive BLYP, BP86,
PW91, PBE og HCTH120 såvel som meta-GGA-funktionalet TPSS
- Hybrid-XC-funktionaler med eksakt Hartree-Fockudveksling (HFX)
inklusive B3LYP, PBE0 og MCY3
- Dobbelthybridfunktionaler inklusive B2PLYP og B2GPPLYP
- Yderligere XC-funktionaler med LibXC
- Dispersionskorrektioner via parpotentialmodellerne DFT-D2 og DFT-D3
- Ikke-lokale van der Waals-korrektioner for XC-funktionaler inklusive
B88-vdW, PBE-vdW og B97X-D
- DFT+U-korrektion (Hubbard)
- Tæthedsfit for DFT via Blöchl eller tæthedsafledte atomare
punktladninger (DDAPC) og HFX via »auxiliary density matrix methods«
(ADMM) og for MP2/RPA via Resolution-of-identity (RI)
- Tynde (»sparse«) matrixrepræsentationer og prescreeningteknikker
for lineært skalerende udregning af Kohn-Sham-matrixelementer (KS)
- Orbitaltransformation (OT) eller direkte inversion af det iterative
underrum (DIIS) til selvkonsistent minimering (SCF)
- Local Resolution-of-Identity Projector Augmented Wave-metode (LRIGPW)
- Energier med absolut lokaliseret molekylorbital-SCF (ALMO-SCF) til
lineært skalerende molekylsystemer
- Exciterede tilstande via tidsafhængig
tæthedsfunktionalperturbationsteori (TDDFPT)
Ab-initio-molekylærdynamik:
- Born-Oppenheimer-molekylærdynamik (BOMD)
- Ehrenfest-molekylærdynamik (EMD)
- PS-ekstrapolation af begyndelsesbølgefunktion
- Tidsreversibel altid stabil predictor-corrector-integrator (ASPC)
- Approksimativ Car-Parrinello-agtig Born-Oppenheimer-molekylærdynamik
med Langevin (Andengenerations Car-Parrinello-molekylærdynamik (SGCP))
Blandede kvante-/klassiske simulationer (QM/MM):
- Multigrid-metoder til evaluering af Coulombvekselvirkninger mellem
kvante- og klassiske dele
- Håndtering af periodiske grænsebetingelser ved hjælp af lineært
skalerende elektrostatisk kobling
- Adaptiv QM/MM
Yderligere funktioner omfatter:
- Enkeltpunktsenergier, geometrioptimeringer og frekvensberegninger
- Adskillige algoritmer til nudged elastic band (NEB) til beregning af
minimumenergivej (B-NEB, IT-NEB, CI-NEB, D-NEB)
- Global optimering af geometrier.
- Solvation via Self-Consistent Continuum Solvation-modellen (SCCS)
- Semiempiriske beregninger med parametriseringerne AM1, RM1, PM3, MNDO,
MNDO-d, PNNL og PM6, tight-binding med tæthedsfunktionalteori (DFTB)
og tight-binding med selfkonsistent polarisering (SCP-TB) med valgfri
periodicitet
- Klassiske molekylærdynamiksimulationer (MD) i det mikrokanoniske
ensemble (NVE) eller kanoniske ensemble (NVT) med Nose-Hoover og
kanonisk sampling gennem termostater der omskalerer hastigheder (CSVR)
- Metadynamik inklusive veltempereret metadynamik til fri
energi-beregninger
- Klassiske kraftfeltsimuleringer (MM)
- Monte Carlo-simuleringer med Kohn-Sham-DFT
- Statiske (f.eks. spektra) og dynamiske (f.eks. diffusion) egenskaber
- ATOM-koden til at generere pseudopotentialer
- Integreret optimering af molekylære basissæt
CP2K implementerer ikke konventionel Car-Parinello-molekylærdynamik (CPMD).
|
|
elk-lapw
Kun-elektron tæthed-funktionel elektronisk strukturkode
|
Versions of package elk-lapw |
Release | Version | Architectures |
buster | 5.4.24-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 4.0.15-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
jessie | 2.3.22-1 | amd64,armel,armhf,i386 |
sid | 9.6.8-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bookworm | 8.4.30-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
bullseye | 6.3.2-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
upstream | 10.1.15 |
|
License: DFSG free
|
ELK er en all-electron full-potential linearised augmented-plane wave-kode
(FP-LAPW). Ved ikke at inkludere pseudopotentialer kan Elk tilbyde meget
troværdige resultater med høj præcision og det fungerer for alle kemiske
elementer. Inkluderede funktioner:
- FP-LAPW-basis med »local-orbitals«
- APW radial afledt matchning til vilkårlige rækkefølger på muffin-tin-
overflade (super-LAPW osv.)
- Vilkårligt antal af lokal-orbitale er tilladt (alle kernetilstande kan
gøres valens for eksempel
- Alle energier opløst i komponenter
- Forces - inklusive ufuldstændige basissæt (IBS) og kernekorrektioner
fungerer med spin-orbit kobling, ikke-collinear magnetisme og LDA+U
- LSDA-, GGA- og (kun-potentielt) meta-GGA-funktionaler er tilgængelige
- LDA+U: fuldt lokaliseret begræsning (FLL), omkring middelfelt (AFM) og
interpolation mellem de to; fungerer med SOC, NCM og spin-spirals
- Isolerede molekyler eller periodiske systemer
- Grundlæggende tilstande behandlet med radial Dirac-ligningen
- Spin-orbit coupling (SOC) inkluderet i »second-variational« skema
- Non-collinear magnetism (NCM) med arbitrær on-site magnetiske felter
- Fast spin-moment-kalkulationer (med SOC og NCM)
- Time-dependent density functional theory (TDDFT) for lineær optisk
svarkalkulationer
- Første-orden optisk svar
- Non-linear optical (NLO) anden harmonisk oprettelse
Elk parallelliseres via hybrid OpenMP/OpenMPI.
|
|
ergo
Kvante-kemiprogram for beregninger i stor skala
|
Versions of package ergo |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 3.8-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
stretch | 3.5-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x |
sid | 3.8.2-1.1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
jessie | 3.4.0-1 | amd64,armel,armhf,i386 |
bookworm | 3.8-1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 3.5-1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
|
License: DFSG free
|
ErgoSCF er et kvantekemisk program for storstilet selvkonsistent
feltberegninger. Den anvender moderne lineære skaleringsteknikker såsom
hurtig multipole-metoder, hierarkisk sparsom matrix-algebra, tæthedsmatrix
rensning, og effektiv integreret screening. Lineær skalering opnås ikke kun
i form af CPU-forbrug, men også hukommelsesudnyttelse. Der bruges gaussiske
basissæt.
Programmet kan beregne enkeltpunkt-energier for de følgende metoder:
- Begrænset og ubegrænset Hartree-Fock-teori (HF)
- Begrænset og ubegrænset Kohn-Sham-tæthedsfunktionelteori (DFT)
- Fuld konfiguration-interaktion (FCI)
De følgende Exchange-Correlational (XC) tæthedsfunktionaler er inkluderet:
- Local Density Approximation (LDA)
- Gradient-corrected (GGA) XC-funktionaler BLYP, BP86, PW91 og PBE
- Hybrid XC-functionaler B3LYP, BHandHLYP, PBE0 og CAMB3LYP
Yderligere funktioner inkluderer:
- Lineære responsberegninger (polarizabilities- og excitation-energier)
for begrænsede referencetæthed
- Eksterne elektriske felter
- Elektron dynamik via tidsafhængig Hartree-Fock (TDHF)
|
|
mpqc
Massively Parallel Quantum Chemistry Program
|
Versions of package mpqc |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 2.3.1-21 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 2.3.1-22 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
jessie | 2.3.1-16 | amd64,armel,armhf,i386 |
stretch | 2.3.1-18+deb9u1 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 2.3.1-19 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bookworm | 2.3.1-22 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
Debtags of package mpqc: |
field | chemistry, physics |
interface | commandline, x11 |
role | program |
scope | utility |
uitoolkit | gtk |
x11 | application |
|
License: DFSG free
|
MPQC er et ab-inito kvantum kemiprogram. Det er specielt designet til at
beregne molekyler på en meget paralleliseret måde.
Programmet kan beregne energier og gradienter for de følgende metoder:
- Closed shell and general restricted open shell Hartree-Fock (HF)
- Density Functional Theory (DFT)
- Closed shell second-order Moeller-Plesset perturbation theory (MP2)
Derudover kan programmet beregne energier for de følgende metoder:
- Open shell MP2 and closed shell explicitly correlated MP2 theory
(MP2-R12)
- Second order open shell pertubation theory (OPT2[2])
- Z-averaged pertubation theory (ZAPT2)
Programmet inkluderer også et internt optimiseringsprogram for
koordinatgeometri.
MPQC er bygget oven på Scientific Computing Toolkit (SC).
Please cite:
The Massively Parallel Quantum Chemistry Program (MPQC), Version 2.3.1, Curtis L. Janssen, Ida B. Nielsen, Matt L. Leininger, Edward F. Valeev, Joseph P. Kenny, Edward T. Seidl, Sandia National Laboratories, Livermore, CA.
(2008)
|
|
mpqc3
Massively Parallel Quantum Chemistry Program
|
Versions of package mpqc3 |
Release | Version | Architectures |
buster | 0.0~git20170114-4.1 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 0.0~git20170114-4 | amd64,arm64,i386,mips64el,ppc64el |
|
License: DFSG free
|
MPQC3 er et ab-inito kvantekemi program. Det er specielt designet til at
beregne molekyler på en eksplicit korreleret måde.
Det kan beregne energier og gradienter for de følgende metoder:
- Hartree-Fock (HF)
- Density Functional Theory (DFT)
- Second-order Moeller-Plesset pertubation theory (MP2)
Derudover kan det beregne energier for de følgende metoder:
- Local MP2 (LMP2)
- Explicitly-correlated density-fitted MP2 (DF-MP2-F12)
- Explicitly-correlated density-fitted coupled-cluster singles doubles
(DF-CCSD-F12)
- Explicitly-correlated density-fitted coupled-cluster singles doubles
med perturbative triples (DF-CCSD(T)-F12)
- Explicitly-correlated density-fitted complete active space SCF
(DF-CASSCF-F12)
- Explicitly-correlated density-fitted multi-reference configuration
interaction (DF-MRCI-F12)
Programmet inkluderer også et internt optimiseringsprogram for
koordinatgeometri.
|
|
nwchem
??? missing short description for package nwchem :-(
|
Versions of package nwchem |
Release | Version | Architectures |
buster | 6.8.1-5 | amd64,arm64,armhf,i386 |
bullseye | 7.0.2-1 | amd64,arm64,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x |
sid | 7.2.3-6 | all |
bookworm | 7.0.2-4 | all |
jessie | 6.5+r26243-4 | amd64,armel,armhf,i386 |
Debtags of package nwchem: |
field | chemistry |
role | program |
|
License: DFSG free
|
|
|
openmolcas
|
Versions of package openmolcas |
Release | Version | Architectures |
bullseye | 20.10-2 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
bookworm | 22.10-1 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,s390x |
sid | 23.10-1 | amd64,arm64,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
|
License: DFSG free
|
Nøglefunktionerne i OpenMolcas er den flerkonfigurationsmæssige fremgangsmåde til den elektroniske struktur.
Kan beregne energier, gradienter og hessianer for de følgende metoder:
- Hartree-Fock SCF (HF)
- Complete active space SCF (CASSCF)
Kan beregne energier og gradienter for de følgende metoder:
- Hartree-Fock (HF)
- Density-Functional Theory (DFT)
- Second-order Moeller-Plesset perturbation theory (MP2)
- Complete and restricted active space SCF (CASSCF/RASSCF)
Derudover kan der beregnes energier for de følgende metoder:
- Closed shell Moeller-Plesset perturbation theory (MP2)
- Complete active space second order perturbation theory (CASPT2)
- Coupled-cluster singles doubles (CCSD), optionally wihth
Cholesky-Decomposition (CD)/Resolution-of-the Identity (RI)
- CD/RI Coupled-cluster singles doubles with perturbative
triples (CCSD(T))
- Density Matrix Renormalization Group SCF (DMRG-SCF)
|
|
psi3
Kvantum kemisk programpakke
|
Versions of package psi3 |
Release | Version | Architectures |
buster | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armhf,i386 |
jessie | 3.4.0-5 | amd64,armel,armhf,i386 |
bookworm | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
sid | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bullseye | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
stretch | 3.4.0-6 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
Debtags of package psi3: |
field | chemistry, physics |
interface | commandline |
role | program |
science | calculation |
scope | suite |
use | calculating |
|
License: DFSG free
|
PSI3 er et ab-initio quantum chemistry program. Det er specielt designet
til præcist at beregne egenskaber for små til mellemstørrelse molekyler,
med brug af højt korrelerede teknikker.
Programmet kan beregne energier og overgange for de følgende metoder:
- Closed shell and general restricted open shell Hartree-Fock (RHF/ROHF)
(inklusive analytiske hessianer for RHF)
- Closed shell Moeller-Plesset pertubation theory (MP2)
- Complete active space SCF (CASSCF)
- Coupled-cluster singles doubles (CCSD)
- Coupled-cluster singles doubles with pertubative triples (CCSD(T))
(kun for ubegrænsede (UHF) reference-wavefunktioner)
Derudover kan programmet beregne energier for de følgende metoder:
- Unrestricted open shell Hartree-Fock (UHF)
- Closed/open shell Moeller-Plesset pertubation theory (MP2)
- Closed shell explicitly correlated MP2 theory (MP2-R12) and spin-
component scaled MP2 theory (SCS-MP2)
- Multireference configuration-interaction (MRCI)
- Coupled-cluster singles doubles with pertubative triples (CCSD(T))
- Second/third-order approximate coupled-cluster singles doubles (CC2/CC3)
- Multireference coupled-cluster singles doubles (MRCCSD)
- Closed shell and general restricted open shell equation-of-motion
coupled-cluster singles doubles (EOM-CCSD)
Yderligere funktioner inkluderer:
- Fleksibelt, modulært og tilpasningsparat inddataformat
- Spændte tilstandsberegninger med CC2/CC3-, EOM-CCSD-, CASSCF-, MRCI- og
MRCCSD-metoderne
- Internal coordinate geometry optimizer
- Harmonic frequencies calculations
- One-electron properties like dipole/quadrupole moments, natural
orbitals, electrostatic potential, hyperfine coupling constants or spin
density
- Udnyttelse af molekylær point-group-symmetri for at øge effektivitet
|
|
psi4
Kvantum kemisk programpakke
|
Versions of package psi4 |
Release | Version | Architectures |
jessie | 4.0~beta5+dfsg-2 | amd64,armel,armhf,i386 |
sid | 1.3.2+dfsg-5 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x |
bullseye | 1.3.2+dfsg-2 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
buster | 1.2.1-2 | amd64,arm64,armhf,i386 |
stretch | 1.0-1 | amd64,arm64,armhf,i386,mips64el,ppc64el,s390x |
bookworm | 1.3.2+dfsg-5 | amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x |
upstream | 1.9.1 |
|
License: DFSG free
|
PSI4 er et ab-initio kvantekemiprogram. Det er specielt designet til
nøjagtigt at beregne egenskaber for små til mellemstore molekyler ved hjælp
af højt korrelerede teknikker. PSI4 er den parallelle efterfølger til PSI3
og indeholder mange moderne teoretiske metoder.
It can compute energies, gradients and hessians for the following methods:
- Restricted Hartree-Fock (RHF)
It can compute energies and gradients for the following methods:
- Restricted, unrestricted and general restricted open shell Hartree-Fock
(RHF/ROHF)
- Restricted, unrestricted and general restricted open shell
Densitry-Functional Theory, including density-fitting (DF-DFT)
- Density Cumulant Functional Theory (DCFT)
- Density-fitted Moeller-Plesset perturbation theory (DF-MP2)
- Density-fitted Orbital-Optimized MP2 theory (DF-OMP2)
- (Orbital-Optimized) MP3 theory (OMP3/MP3)
- Coupled-cluster singles doubles (CCSD)
- Density-fitted coupled-cluster singles doubles (DF-CCSD) and with
perturbative triples (DF-CCSD(T))
- Second-order approximate coupled-cluster singles doubles (CC2)
- Equation-of-motion coupled-cluster singles doubles (EOM-CCSD)
Additionally, it can compute energies for the following methods:
- Spin-component scaled MP2 theory (SCS-MP2)
- Fourth order Moeller-Plesset perturbation theory (MP4)
- Density-fitted symmetry-adapted perturbation theory (DF-SAPT)
- Density-fitted complete active space SCF (DF-CASSCF)
- Configuration-interaction singles doubles (CISD)
- Full configuration-interaction (FCI)
- Closed-shell Density-fitted coupled-cluster singles doubles (DF-CCSD)
- Closed-shell Density-fitted Coupled-cluster singles doubles with
perturbative triples (DF-CCSD(T))
- Second/third-order approximate coupled-cluster singles doubles (CC2/CC3)
- Mukherjee Multireference coupled-cluster singles doubles theory (mk-MRCCSD)
- Mukherjee Multireference coupled-cluster singles doubles with perturbative
triples theory (mk-MRCCSD(T))
- Second order algebraic-diagrammatic construction theory (ADC(2))
- Quadratic configuration interaction singles doubles (QCISD)
- Quadratic configuration interaction singles doubles with perturbative
triples (QCISD(T))
- Density Matrix Renormalization Group SCF (DMRG-SCF), CASPT2 (DMRG-CASPT2)
and CI (DMRG-CI)
Further features include:
- Flexible, modular and customizable input format via Python
- Excited state calculations with the EOM-CC2/CC3, EOM-CCSD, ADC(2), MRCI and
mk-MRCC methods
- Utilization of molecular point-group symmetry to increase efficiency
- Internal coordinate geometry optimizer
- Harmonic frequencies calculations (via finite differences)
- Potential surface scans
- Counterpoise correction
- One-electron properties like dipole/quadrupole moments, transition dipole
moments, natural orbitals occupations or electrostatic potential
- Composite methods like complete basis set extrapolation or G2/G3
- Scalar-relativistic corrections via two-component approach (X2C)
Please cite:
Robert M. Parrish, Lori A. Burns, Daniel G. A. Smith, Andrew C. Simmonett, A. Eugene DePrince, Edward G. Hohenstein, Uğur Bozkaya, Alexander Yu. Sokolov, Roberto Di Remigio, Ryan M. Richard, Jérôme F. Gonthier, Andrew M. James, Harley R. McAlexander, Ashutosh Kumar, Masaaki Saitow, Xiao Wang, Benjamin P. Pritchard, Prakash Verma, Henry F. Schaefer, Konrad Patkowski, Rollin A. King, Edward F. Valeev, Francesco A. Evangelista, Justin M. Turney, T. Daniel Crawford and C. David Sherrill:
Psi4 1.1: An Open-Source Electronic Structure Program Emphasizing Automation, Advanced Libraries, and Interoperability.
(eprint)
J. Chem. Theory Comput.
13(7):3185-3197
(2017)
|
|
|