PAN Blend Project
Summary
grazing-incidence
Grazing-forekomst for røntgenfoton- og neutrondiffraktion

Denne metapakke vil installere alle programmerne for GID, GIXD, GIND, GISAS, GISAXS og GISANS.

Description

For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:

If you discover a project which looks like a good candidate for PAN Blend to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to send a description of that project to the PAN Blend mailing list

Links to other tasks

PAN Blend grazing-incidence packages

Official Debian packages with high relevance

binoculars
Overfladerøntgendiffraktion 2D-detektordatareduktion
Versions of package binoculars
ReleaseVersionArchitectures
bullseye0.0.6-1all
bookworm0.0.13-1all
bookworm-backports0.0.19-1~bpo12+1all
sid0.0.19-1all
buster0.0.4-1all
Popcon: 4 users (1 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

BINoculars er et værktøj til datareduktion og analyse af store sæt af overfladediffraktionsdata, som er blevet indhentet med en todimensional røntgendetektor. Intensiteten for hvert billedpunkt på en todimensional detektor vises på en tredimensional gitter i gensidige-gitter koordinater ved hjælp af en binning-algoritme. Dette giver mulighed for hurtig erhvervelse og behandling af data med høj opløsning og resulterer i en væsentlig reduktion af dataens størrelse. Den efterfølgende analyse fortsætter derefter i et gensidigt rum. Programmet har udviklet sig fra de specifikke behov i ID03-strålen på ESRF, men det har et modulært design og kan let justeres og forlænges til arbejde med data fra andre stråler eller fra andre målingsteknikker.

bornagain
Simuler og tilpas røntgen og neutron GISAS - binær fil
Versions of package bornagain
ReleaseVersionArchitectures
sid22~git20241218175952.966c34a+ds3-1amd64,armel,armhf,mips64el
trixie22~git20240726093306.cb41cc4+ds3-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
bullseye1.18.0-1amd64,i386
sid22~git20240726093306.cb41cc4+ds3-2arm64,i386,ppc64el,riscv64,s390x
bookworm1.19.0-3amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
upstream22~git20250114130527.1c2e0ba
Popcon: 3 users (0 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

BornAgain er en programpakker til at simulere og tilpasse lille vinkelspredning ved grazing-tilfælde. Programmet understøtter analyse af både røntgendata (GISAXS) og neutrondata (GISANS). Beregninger udføres inden for rammerne af Distorted Wave Born approximation (DWBA). BornAgain har en grafisk brugergrænseflade til interaktiv brug såvel som en generisk Python- og C++-ramme til modellering af prøver i flere lag med glatte eller ru grænseflader og med forskellige typer indlejrede nanopartikler.

bornagain-doc
Simuler og tilpas røntgen og neutron GISAS - dokumentation
Versions of package bornagain-doc
ReleaseVersionArchitectures
bullseye1.18.0-1all
bookworm1.19.0-3all
sid22~git20241218175952.966c34a+ds3-1all
sid22~git20240726093306.cb41cc4+ds3-2all
trixie22~git20240726093306.cb41cc4+ds3-2all
upstream22~git20250114130527.1c2e0ba
Popcon: 0 users (0 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

BornAgain er en programpakker til at simulere og tilpasse lille vinkelspredning ved grazing-tilfælde. Programmet understøtter analyse af både røntgendata (GISAXS) og neutrondata (GISANS). Beregninger udføres inden for rammerne af Distorted Wave Born approximation (DWBA). BornAgain har en grafisk brugergrænseflade til interaktiv brug såvel som en generisk Python- og C++-ramme til modellering af prøver i flere lag med glatte eller ru grænseflader og med forskellige typer indlejrede nanopartikler.

python-xrayutilities-doc
X-rays data reduction and analysis (documentation)
Versions of package python-xrayutilities-doc
ReleaseVersionArchitectures
bullseye1.7.1-1all
sid1.7.8-1all
trixie1.7.8-1all
bookworm1.7.4-1all
Popcon: 0 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

xrayutilities is a collection of scripts used to analyze x-ray diffraction data. It consists of a Python package and several routines coded in C. It especially useful for the reciprocal space conversion of diffraction data taken with linear and area detectors.

This package includes the manual in HTML format.

python3-bornagain
Simuler og tilpas røntgen og neutron GISAS - Python 3
Versions of package python3-bornagain
ReleaseVersionArchitectures
bullseye1.18.0-1amd64,i386
trixie22~git20240726093306.cb41cc4+ds3-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
sid22~git20241218175952.966c34a+ds3-1amd64,armel,armhf,mips64el
bookworm1.19.0-3amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
sid22~git20240726093306.cb41cc4+ds3-2arm64,i386,ppc64el,riscv64,s390x
upstream22~git20250114130527.1c2e0ba
Popcon: 3 users (0 upd.)*
Newer upstream!
License: DFSG free
Git

BornAgain er en programpakker til at simulere og tilpasse lille vinkelspredning ved grazing-tilfælde. Programmet understøtter analyse af både røntgendata (GISAXS) og neutrondata (GISANS). Beregninger udføres inden for rammerne af Distorted Wave Born approximation (DWBA). BornAgain har en grafisk brugergrænseflade til interaktiv brug såvel som en generisk Python- og C++-ramme til modellering af prøver i flere lag med glatte eller ru grænseflader og med forskellige typer indlejrede nanopartikler.

Denne pakke indeholder Pythonbindingerne til brug i skripter.

python3-denss
calculate electron density from a solution scattering profile
Versions of package python3-denss
ReleaseVersionArchitectures
bullseye0.0.1+20200710gac8923a-2all
bookworm0.0.1+20200710gac8923a-2all
trixie0.0.1+20200710gac8923a-2all
sid0.0.1+20200710gac8923a-2all
Popcon: 6 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

DENSS is an algorithm used for calculating ab initio electron density maps directly from solution scattering data. DENSS implements a novel iterative structure factor retrieval algorithm to cycle between real space density and reciprocal space structure factors, applying appropriate restraints in each domain to obtain a set of structure factors whose intensities are consistent with experimental data and whose electron density is consistent with expected real space properties of particles.

DENSS utilizes the NumPy Fast Fourier Transform for moving between real and reciprocal space domains. Each domain is represented by a grid of points (Cartesian), N x N x N. N is determined by the size of the system and the desired resolution. The real space size of the box is determined by the maximum dimension of the particle, D, and the desired sampling ratio. Larger sampling ratio results in a larger real space box and therefore a higher sampling in reciprocal space (i.e. distance between data points in q). Smaller voxel size in real space corresponds to higher spatial resolution and therefore to larger q values in reciprocal space.

python3-genx
Differential evolutionsalgoritme for tilpasning
Versions of package python3-genx
ReleaseVersionArchitectures
bullseye3.0.2-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie3.7.4+dfsg-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
sid3.7.4+dfsg-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
Popcon: 2 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

GenX er et alsidigt program, der bruger differential evolutionsalgoritme for tilpasning, primært, af røntgen- og neutronreflektivitetsdata, senest også røntgendiffraktionsdata. Differential evolutionsalgoritmen er en robust optimeringsmetode, der undgår lokal minima, men samtidig er meget effektiv. GenX er skrevet i Python og bruger pakken wxpython for den grafiske brugerflade (GUI). En model til tilpasning er defineret enten via et GUI-udvidelsesmodul eller via et Pythonskript. Muligheden for at skripte alt gør det nemt at udvikle helt nye tilpasningsmodeller. GenX er derfor ekstrem modulopbygget, hvilket gør det muligt at udvide programmet med modeller og udvidelsesmoduler for røntgen- og neutron specular-reflektivitet, off-specular røntgen-reflektivitet og røntgen-overfladediffration.

python3-refnx
Neutron og røntgen-reflektometrianalyse i Python
Versions of package python3-refnx
ReleaseVersionArchitectures
sid0.1.51-4amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
trixie0.1.51-4amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
Popcon: 2 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Fleksibel, funktionsrig Pythonpakke for generel kurvetilpasningsanalyse, specifikt neutron og røntgen-reflektometridata.

Den bruger flere scipy.optimize-algoritmer til at tilpasse data og esitmering af parameterusikkerheder. Ligesom scipy-algoritmerne refnx bruger emcee Affine Invariant Marko chain Monte Carlo (MCMC) Ensemble-sampleren for bayesiansk parameterestimering.

python3-xrayutilities
Datareduktion og analyse for røntgen - Python 3
Versions of package python3-xrayutilities
ReleaseVersionArchitectures
trixie1.7.8-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
sid1.7.8-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
bookworm1.7.4-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bullseye1.7.1-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Popcon: 6 users (2 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Xrayutilities er en samling af skripter brugt til at analysere røntgenstrålers diffraktionsdata. Samlingen består af en Pythonpakke og flere rutiner kodet i C. Er speciel nyttig for gensidigt rumkonvertering af diffraktionsdata taget med lineære detektorer og arealdetektorer.

Dette er Python 3-versionen af pakken.

Packaging has started and developers might try the packaging code in VCS

python3-moviepy
Video editing with Python
Versions of package python3-moviepy
ReleaseVersionArchitectures
VCS0.0~git20221010154236.858bb81-1all
Versions and Archs
License: MIT
Debian package not available
Git
Version: 0.0~git20221010154236.858bb81-1

MoviePy is a Python library for video editing: cutting, concatenations, title insertions, video compositing (a.k.a. non-linear editing), video processing, and creation of custom effects.

No known packages available

fitgisaxs
?
License: ?
Debian package not available
gsas
?
License: ?
Debian package not available
isgisaxs
gisaxs -- diffraction
License: GPL3+
Debian package not available
*Popularitycontest results: number of people who use this package regularly (number of people who upgraded this package recently) out of 245938