DebiChem Project
Summary
Chemical Formula/Structure Editors
Edytory struktur i formuł chemicznych DebiChem

Ten metapakiet zainstaluje szuflady do struktur chemicznych, które mogą być użyteczne dla chemików.

Description

For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:

If you discover a project which looks like a good candidate for DebiChem to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to send a description of that project to the DebiChem mailing list

Links to other tasks

DebiChem Chemical Formula/Structure Editors packages

Official Debian packages with high relevance

bkchem
Edytor struktur chemicznych
Versions of package bkchem
ReleaseVersionArchitectures
sid0.14.0~pre4+git20211228-4all
jessie0.13.0-4all
stretch0.13.0-5all
buster0.13.0-6all
bookworm0.14.0~pre4+git20211228-3all
trixie0.14.0~pre4+git20211228-4all
Debtags of package bkchem:
fieldchemistry
roleprogram
Popcon: 6 users (3 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

BKchem to darmowy program do rysowania chemicznego napisany w języku Python.

Program udostępnia następujące funkcje:

  • Rysowanie (wiązania po wiązaniu; szablonów dla wspólnych pierścieni; rozszerzanie wspólnych grup; rysowanie rodników, ładunków, strzałek; obsługa kolorów itd.).
  • Edycja (nieograniczone możliwości cofania i ponawiania; wyrównywanie; skalowanie; obracanie (2D, 3D) itd.).
  • Eksport/Import (w pełni obsługiwany eksport SVG, OpenOffice.org-Draw, EPS; podstawowa obsługa importu i eksportu CML1 i CML2).
Screenshots of package bkchem
chemtool
Program do rysowania struktur chemicznych
Versions of package chemtool
ReleaseVersionArchitectures
jessie1.6.14-1amd64,armel,armhf,i386
buster1.6.14-3amd64,arm64,armhf,i386
bullseye1.6.14-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bookworm1.6.14-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie1.6.14-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
sid1.6.14-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
stretch1.6.14-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package chemtool:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
scopeapplication
uitoolkitgtk
useediting, learning
works-withimage, image:vector
works-with-formatsvg
x11application
Popcon: 25 users (15 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Chemtool to dwuwymiarowy, bazujący na GTK+, edytor struktur chemicznych do X11. Obsługuje wiele typów wiązań, większość rodzajów tekstu potrzebnych do oznaczania składu chemicznego oraz krzywe/łukowe/zakrzywione strzałki.

Rysunki mogą być eksportowane do formatu MOL oraz PDB, SVG lub XFig - do dalszych adnotacji, jako rysunek PiCTeX, bitmapa lub pliki Postscript (kilka z nich przez fig2dev towarzyszący programowi XFig).

Pakiet zawiera również program pomocniczy - cht, do obliczania sumy wzoru i (dokładnej) masy cząsteczkowej z rysunku stworzonego przez Chemtool. Cht może być wywoływany bezpośrednio przez Chemtool lub poprzez konsolę.

Please cite: Matthias Brüstle: Chemtool - Moleküle zeichnen mit dem Pinguin. (eprint) Nachr. Chem. 49(11):1310-1313 (2001)
Screenshots of package chemtool
easychem
Wyświetlanie wysokiej jakości cząsteczek i dwuwymiarowych formuł chemicznych
Versions of package easychem
ReleaseVersionArchitectures
stretch0.6-8amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster0.6-8amd64,arm64,armhf,i386
bullseye0.6-9amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bookworm0.6-9amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie0.6-9amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
jessie0.6-8amd64,armel,armhf,i386
sid0.6-9amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
Debtags of package easychem:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
uitoolkitgtk
useediting, learning, viewing
x11application
Popcon: 18 users (17 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

EasyChem to program, który pomaga tworzyć wysokiej jakości diagramy molekularne i dwuwymiarowe formuły chemiczne, które można eksportować do formatów PDF, PS, LaTeX i FIG.

EasyChem został pierwotnie zaprojektowany w celu tworzenia diagramów do książek związanych z chemią i jest obecnie często wykorzystywany pod tym względem w komercyjnych i niekomercyjnych książkach tego rodzaju.

Screenshots of package easychem
gchempaint
2D chemical structures editor for the GNOME2 desktop
Versions of package gchempaint
ReleaseVersionArchitectures
sid0.14.17-6.2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
jessie0.14.9-1amd64,armel,armhf,i386
stretch0.14.15-1+deb9u1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
buster0.14.17-1.1amd64,arm64,armhf,i386
bullseye0.14.17-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bookworm0.14.17-6.1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package gchempaint:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
suitegnome
uitoolkitgtk
useediting, learning
x11application
Popcon: 23 users (19 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

GChemPaint is an editor for 2D chemical structures with a multiple document interface. Drawn molecules can be searched at NIST Webbook and PubChem.

osra
optical structure recognition
Versions of package osra
ReleaseVersionArchitectures
bookworm2.1.3-3amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
trixie2.1.3-3amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
sid2.1.3-3amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
Popcon: 1 users (0 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

OSRA is a utility designed to convert graphical representations of chemical structures, as they appear in journal articles, patent documents, textbooks, trade magazines etc., into SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry Specification) - a computer recognizable molecular structure format. OSRA can read a document in any of the over 90 graphical formats parseable by ImageMagick - including GIF, JPEG, PNG, TIFF, PDF, PS etc., and generate the SMILES representation of the molecular structure images encountered within that document.

Remark of DebiChem team: Packaging was discussed at

http://lists.alioth.debian.org/pipermail/debichem-devel/2009-November/002236.html

xdrawchem
Edytor struktur i reakcji chemicznych
Maintainer: Georges Khaznadar
Versions of package xdrawchem
ReleaseVersionArchitectures
trixie1.11.1-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
sid1.11.1-1amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,ppc64el,riscv64,s390x
buster1.10.2.1-2amd64,arm64,armhf,i386
stretch2.0-6amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
jessie2.0-3amd64,armel,armhf,i386
bullseye1.11.0-2amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
bookworm1.11.0-4amd64,arm64,armel,armhf,i386,mips64el,mipsel,ppc64el,s390x
Debtags of package xdrawchem:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
uitoolkitqt
useediting, learning, viewing
x11application
Popcon: 12 users (2 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Git

Xdrawchem jest edytorem 2D dla struktur i reakcji chemicznych. Program odzwierciedla możliwości komercyjnego pakietu ChemDraw i jest zgodny z nim, a także z innymi formatami chemicznymi poprzez OpenBabel.

Ta spakowana wersja wywodzi się z oryginalnego projektu dostępnego pod adresem: https://gitlab.com/yamanq/xdrawchem, ponieważ poprzednia wersja nie była już aktywnie utrzymywana. Więcej informacji na ten temat znajduje się w pliku dotyczącym praw autorskich.

Screenshots of package xdrawchem
*Popularitycontest results: number of people who use this package regularly (number of people who upgraded this package recently) out of 245494