DebiChem C/C++/Fortran Development packages

Questo pacchetto è un aggiornamento binario incompatibile al pacchetto blas-dev. Sono state incorporate svariate modifiche secondarie all'interfaccia C.

BLAS (Basic Linear Algebra Subroutines) è un insieme di procedure efficienti per la maggior parte delle operazioni di base su matrici e vettori. È ampiamente usato come base per altri software di algebra lineare di qualità elevata, per esempio lapack e linpack. Questa implementazione è quella di riferimento per Fortran 77 che si trova dentro netlib.

Questo pacchetto contiene una versione statica della libreria.

BTAS (Basic Tensor Algebra Subroutines) è una libreria per algebra tensoriale. È un'implementazione di riferimento della specifica concettuale del Tensor Working Group.

Questo pacchetto contiene le librerie statiche e i file header.

DBCSR is a library designed to efficiently perform sparse matrix matrix multiplication, among other operations. It is MPI and OpenMP parallel.

ELPA sta per Eigenvalue SoLvers for Petaflop-Applications.

Questa versione contiene i moduli Fortran90 e la libreria statica.

La libreria FFTW calcola le trasformate di Fourier veloci (FFT) in una o più dimensioni. È estremamente veloce. Questo pacchetto contiene la libreria linkata staticamente, i file header e i programmi di test.

Questo pacchetto contiene i file header e le librerie statiche. Per la documentazione vedere libfftw3-doc.

GAlib contains a set of C++ genetic algorithm objects. The library includes tools for using genetic algorithms to do optimization in any C++ program using any representation and genetic operators. The documentation includes an extensive overview of how to implement a genetic algorithm as well as examples illustrating customizations to the GAlib classes.

This package contains the development files.

The LIBINT library is used to evaluate the traditional (electron repulsion) and certain novel two-body matrix elements (integrals) over Cartesian Gaussian functions used in modern atomic and molecular theory. The idea of the library is to let computer write optimized code for computing such integrals. There are two primary advantages to this: much less human effort is required to write code for computing new integrals, and code can be optimized specifically for a particular computer architecture (e.g., vector processor).

LIBINT has been utilized to implement methods such as Hartree-Fock (HF) and Kohn-Sham density functional theory (KS DFT), second-order Moeller-Plesset perturbation theory (MP2), coupled cluster singles and doubles (CCSD) method, as well as explicitly correlated R12 methods.

This package contains the development header files.

The Libint2 library is used to evaluate the traditional (electron repulsion) and certain novel two-body matrix elements (integrals) over Cartesian Gaussian functions used in modern atomic and molecular theory. The idea of the library is to let computer write optimized code for computing such integrals. There are two primary advantages to this: much less human effort is required to write code for computing new integrals, and code can be optimized specifically for a particular computer architecture (e.g., vector processor).

Libint2 has been utilized to implement methods such as Hartree-Fock (HF) and Kohn-Sham density functional theory (KS DFT), second-order Moeller-Plesset perturbation theory (MP2), coupled cluster singles and doubles (CCSD) method, as well as explicitly correlated R12 methods.

This package contains the static library and header files.

LAPACK versione 3.X è una libreria FORTRAN esaustiva che effettua operazioni di algebra lineare con incluse le inversioni di matrici, le soluzioni del metodo dei minimi quadrati di insiemi lineari di equazioni, analisi di autovettori, decomposizione ai valori singolari, ecc. È un pacchetto veramente esaustivo e degno di rispetto che ha trovato un vasto uso nella comunità scientifica.

Questo pacchetto contiene una versione statica della libreria.

MADNESS (Multiresolution Adaptive Numerical Environment for Scientific Simulation) provides a high-level environment for the solution of integral and differential equations in many dimensions using adaptive, fast methods with guaranteed precision based on multi-resolution analysis and novel separated representations. There are three main components to MADNESS. At the lowest level is a new petascale parallel programming environment that increases programmer productivity and code performance/scalability while maintaining backward compatibility with current programming tools such as MPI and Global Arrays. The numerical capabilities built upon the parallel tools provide a high-level environment for composing and solving numerical problems in many (1-6+) dimensions. Finally, built upon the numerical tools are new applications with initial focus upon chemistry, atomic and molecular physics, material science, and nuclear structure.

This package contains the static libraries and the header files.

OpenMM è un toolkit software per eseguire simulazioni molecolari su una varietà di architetture di calcolo ad alte prestazioni. Questo pacchetto fornisce i file header C++ per sviluppare con questa libreria.

PSI3 è un programma di chimica quantistica ab-initio. È progettato specialmente per calcolare accuratamente le proprietà di molecole piccole o medie usando tecniche ad alta correlazione.

Questo pacchetto contiene le librerie statiche e i file header.

Il toolkit Scientific Computing (SC) fornisce librerie di classi C++ per il calcolo scientifico. Sono incluse classi fra le altre cose per la gestione della memoria, il salvataggio e il recupero dello stato degli oggetti, la lettura degli oggetti da un file di input, comunicazioni parallele, algebra delle matrici.

Con questa distribuzione di SC sono fornite librerie con classi che supportano applicazioni di chimica quantistica.

Questo pacchetto include le librerie statiche e i file header.

ScaLAPACK è la versione parallela di LAPACK usata su cluster.

Ci sono pacchetti per le librerie condivise, per le librerie statiche e i file di sviluppo (questo) e per i programmi di test.

Sono inclusi anche:

• PBLAS, Parallel Basic Linear Algebra Subprograms
• BLACS, Basic Linear Algebra Communication Subprograms

Questo è un pacchetto fittizio che dipende dal pacchetto di sviluppo di scalapack compatibile con l'implementazione predefinita di MPI su questa architettura.

Provides C++ API for creating molecular models whose dynamics can be simulated using the SimTK Simbody library. Molmodel is a programmer's toolkit for building reduced-coordinate, yet still all-atom, models of large biopolymers such as proteins, RNA, and DNA. One can control the allowed mobility. By default, Molmodel builds torsion-coordinate models in which bond stretch and bend angles are rigid while bond torsion angles are mobile. But one is able to rigidify or free any subsets of the atoms, such as the rigid benzene ring.

Molmodel is a C++ API for biochemist-friendly molecular modeling that extends the Simbody API to simplify construction of high-performance articulated models of molecules.

This package contains development files.

Spglib è una libreria C per determinare la simmetria dei cristalli. Operazioni di simmetria, gruppi spaziali e altri dati possono essere ottenuti usando questo strumento.

Le funzionalità includono:

• identificazione del tipo di gruppo spaziale;
• ricerca delle operazioni di simmetria;
• ricerca di una cella elementare;
• ricerca di punti k irriducibili;
• affinamento della struttura del cristallo;
• assegnazione della posizione di Wyckoff.

Questo pacchetto contiene la libreria statica e i file header.

TiledArray is a scalable, block-sparse tensor library that is designed to aid in rapid composition of high-performance tensor expressions, appearing for example in many-body quantum mechanics. It allows users to compose tensor expressions of arbitrary complexity that closely resembles the standard mathematical notation.

This package contains the static libraries and the header files.

Questo pacchetto contiene la libreria C statica, gli header C e i moduli Fortran necessari per gli sviluppatori.

LibXC is a library of exchange-correlation (XC) functionals for density-functional theory (DFT). The aim is to provide a portable, well tested and reliable set of exchange and correlation functionals that can be used by other codes.

This package contains the static library, the C headers and the Fortran modules necessary for developers.

This metapackage depends on the development files of the recommended MPI implementation for each platform, currently Open MPI on all of the platforms where it exists, and MPICH on the others. The package which this depends on has alternatives links for the shared libraries libmpi and libmpi++, and for compilers mpicc, mpic++/mpicxx/mpiCC, mpif77 and mpi90 and their manpages.